Juustokakun ainesosia on kolme päätyyppiä. Nämä ovat niitä, jotka tekevät pohjan, tärkeimmän juustokakkusekoituksen ja täytteet tai lisäaromit. Jotkut juustokakutyypit, kuten paistettu New Yorkin juustokakku, saattavat vaatia vain kaksi ensimmäistä juustokakkua. On mahdollista valmistaa kaksi hyvin erilaista juustokakkua käyttäen hyvin erilaisia juustokakun ainesosia, mutta pehmeän juuston käyttämisessä pääainesosana on yksi yhteinen teema.
Ensimmäinen osa valmistettavasta juustokakusta on yleensä pohja. Keksit yleensä murskataan ja sitotaan sitten yhteen sulatetun voin kanssa pohjan muodostamiseksi. On myös mahdollista sekoittaa sokeria tai siirappia. Digestive-tyyppisiä keksejä käytetään yleensä, mutta murskattuja keksejä ja muita kovia tai kuivia keksejä voidaan käyttää erilaisen rakenteen tai maun saamiseksi. Jotkut juustokakut käyttävät sienipohjaa, joka käyttää perinteisiä sienimateriaaleja, kuten jauhoja, munia, sokeria ja voita.
Tavallinen kylmä juustokakku, joka ei vaadi jäädyttämistä, sisältää useita tavallisia juustokakun ainesosia. Pääraaka -aine on pehmeä juusto. Tämä voi olla yleinen pehmeä juusto, mascarpone tai merkkituote. Pehmeä juusto voidaan sekoittaa useiden muiden juustokakun ainesosien kanssa erilaisten makujen tuottamiseksi. Muita yleisiä sekoittimina käytettäviä ainesosia ovat kuoret tai mehu, sulatettu valkoinen suklaa ja kaksinkertainen kerma.
Suklaajuustokakut puolestaan sekoittavat pehmeän juuston kaakaojauheeseen ja/tai sulatettuun tummaan tai maitosuklaaseen. Muita ainesosia, joita voidaan käyttää suklaajuustokakkuun, ovat munat, smetana, tomusokeri ja jopa vaniljakastike. Tämä riippuu suklaan juustokakun luonteesta ja noudatettavasta reseptistä.
Paistetun juustokakun ainekset eroavat hieman kylmemmistä. Suurin ero on jauhojen ja munien läsnäolo. Nämä ovat olennainen osa leivontaprosessia. Muita juustokakkuaineita, joita käytetään paistettujen juustokakkujen, kuten New Yorkin juustokakun, valmistukseen, ovat vaniljauute ja joskus leivinjauhe.
Monilla juustotyypeillä on lisäaromeja. Aromiaineita on kahta päätyyppiä: juustokakun sisällä olevia ja juustokakun päälle asetettavia. Monissa amerikkalaisissa paistetuissa juustokakkuissa on yleensä karamelli-, suklaa- tai hedelmämakuisia pyörteitä juustokakku-sekoituksen sisällä, mikä antaa sille marmoroidun vaikutuksen. Nämä juustokakun ainekset ovat melko yksinkertaisia sekoituksia sokerista ja hedelmäaromeista tai sulatetusta suklaasta.
Englantilaiset juustokakut, kuten Devonshire -juustokakku ja monet muut, laittavat myös viipaleita hedelmiä valmiille juustokakulle. Juustokakun päälle laitettavia hedelmiä ovat mangot, mansikat, vadelmat ja pienet appelsiinit, kuten klementiini ja mandariini. Näihin yhdistetään usein saman makuista hedelmäsiirappia ja kermavaahtoa. Mahdollisia juustokakun ainesosia, joita voidaan laittaa juustokakun päälle, ei ole olennaisesti rajoitettu; kaikki tulee makuun.