Barokkikausi tapahtui Euroopassa vuosien 1600 ja 1750 välillä muodostaen sillan renessanssin ja klassisen ajan välillä. Barokkityökalut olivat yleensä samat kuin renessanssin aikana, vaikka monet kokivat parannuksia teknologisten ja mekaanisten innovaatioiden kautta. Barokkikaudella kehittyi viuluperhe, joka korvasi renessanssin aikana näkyvän jousisoittimien viuluperheen. Näppäimistösoittimilla, kuten uruilla ja cembaloilla, oli päärooli. Puhallinsoittimet olivat myös suosittuja.
Viulut olivat yleisimmin käytettyjä barokin soittimia. Jousisoittimet, joita soitettiin jousilla tänä aikana, poikkesivat nykyaikaisista, koska niissä ei ollut nauhoja. Viulun perhe saavutti huippunsa barokin aikana. Stradivarius loi tänä aikana viulunsa, joita pidetään mestariteoksina, joita kukaan käsityöläinen ei ole kyennyt ylittämään. Muita jousia, joita jousina käytettiin tänä aikana, olivat sello, alttoviulu ja kontrabasso.
Kitara on toinen kielisoitin, jota käytetään barokkimusiikissa. Siinä oli suolistosta valmistettuja nauhoja, jotka oli sidottu kitaran kaulaan. Nämä barokki -instrumentit olivat pienempiä kuin nykyään käytetyt kitarat, ja niissä oli yhdeksän tai kymmenen kieltä.
Barokin aikana orkesterit ilmestyivät ensimmäisen kerran. Trumpetti ja ranskalainen torvi olivat tärkeimmät barokin soittimet vaskiperheessä, joita käytettiin orkestereissa. Toisin kuin modernit trumpetit ja ranskalaiset sarvet, näissä barokkityökaluissa ei ollut venttiilejä, keksintö, joka syntyi vasta 19 -luvulla. Venttiilien puute rajoitti messingin käytön satunnaiseen kukoistukseen lisätäkseen väriä orkesterisävellyksiin. Pasuunoita käytettiin myös satunnaisesti, mutta nämä barokki -instrumentit olivat pienempiä kuin nykyään käytetyt pasuunat.
14 -luvulla keksitty cembalo saavutti suurimman näkyvyytensä barokin aikana Johann Sebastian Bachin sävellyksissä. Useimpien cembalojen muoto oli kapeampi ja pidempi kuin piano, joka kehitettiin vasta 19 -luvulla. Cembaloita kielet kynnettiin, kun näppäimiä painettiin. Joissakin cembaloissa oli kaksi merkkijonoa jokaiseen näppäimeen, ja joissakin oli yksi merkkijono per näppäin. Bach kirjoitti myös monia sävellyksiä uruille.
Oboot, huilut ja fagotit olivat yleisimpiä puupuhaltimien barokkityökaluja, ja renessanssikaudella pidetty nauhuri oli edelleen käytössä. Monet barokin aikaiset huilut rakennettiin niin, että muusikko puhalsi suukappaleeseen toisesta päästä sen sijaan, että puhalsi reiän yli modernin huilun soittotavassa. Tämän ajan puupuhallinsoittimet valmistettiin puusta.