Korkealla estrogeenillä on monia negatiivisia vaikutuksia, jotka voivat vaikuttaa sekä mieleen että kehoon. Joitakin yleisimpiä oireita ovat päänsärky, väsymys, kuumat aallot, kuukautishäiriöt ja syöpä. Se voi myös johtaa mielialan vaihteluihin, muistin heikkenemiseen, ahdistukseen ja masennukseen. Vaikka se on naishormoni, sitä esiintyy myös miehillä ja se voi johtaa gynekomastiaan ja sydänongelmiin.
On olemassa kolme hallitsevaa estrogeenia, jotka tunnetaan nimellä estroni, estradioli ja estrioli, ja joita tasapainottaa toinen naishormoni, joka tunnetaan nimellä progesteroni. Molemmat hormonit ovat välttämättömiä kohdun valmistautumisessa raskauteen. Estrogeeni on myös erittäin tärkeä hyvän luuston terveydelle ja voi auttaa ehkäisemään osteoporoosia auttamalla ylläpitämään terveen kalsiumpitoisuuden luissa. Joissakin tapauksissa keho valmistaa kuitenkin ylimääräisiä määriä estrogeenia eikä tarpeeksi progesteronia tasapainottamaan sitä. Tämän seurauksena se luo korkeita estrogeenipitoisuuksia, jotka tunnetaan myös nimellä estrogeenivalta.
Korkeita estrogeenipitoisuuksia esiintyy yleensä naisen kuukautiskierron aikana, mikä on usein syy mielialan vaihteluihin, ärtyneisyyteen ja emotionaaliseen epävakauteen tänä aikana. Kuukautisten aikana monet naiset kärsivät yleensä päänsärkyistä, väsymyksestä, turvotuksesta, vatsakrampeista ja rintakipuista. Epäsäännölliset, ohitetut tai raskaat syklit ovat myös estrogeenin epätasapainon vaikutuksia. Ehkäisypillereitä käytetään usein epäsäännöllisten kuukautiskiertojen säätelyyn; ne voivat kuitenkin sisältää paljon estrogeenia, mikä voi johtaa kohonneisiin estrogeenipitoisuuksiin ja hedelmättömyyteen.
Ahdistus, masennus, muistin heikkeneminen ja heikko itseluottamus ovat yleisiä merkkejä estrogeenin epätasapainosta. Naiset, jotka käyvät vaihdevuodet läpi, voivat myös kärsiä oireista, kuten kuumista aalloista ja mielialan vaihteluista. Vaihdevuosien aikana tai sen jälkeen naiset turvautuvat usein estrogeenikorvaushoitoon auttaakseen heitä käsittelemään oireita. Joissakin tapauksissa tämä hoito voi aiheuttaa estradiolitasojen nousun, mikä asettaa nämä naiset alttiiksi muille terveysongelmille, kuten aivohalvaukselle ja syövälle.
On näyttöä siitä, että rintasyöpäsolut voivat syödä estrogeenia ja edistää sen leviämistä sen alkaessa. Tämän seurauksena lääkkeitä määrätään usein estrogeenin tuotannon pysäyttämiseksi tai vähentämiseksi syövän leviämisen estämiseksi. Muita syöpiä, jotka on yhdistetty korkeisiin estrogeenitasoihin, ovat kohdun, kohdun limakalvon ja munasarjasyövät.
Liika estrogeeni miehillä on myös yleistä ja voi johtaa sydänkohtauksiin ja ateroskleroosiin, joka on valtimoiden paksuuntuminen. Tutkimukset osoittavat, että se voi kaksinkertaistaa aivohalvauksen riskin, koska se edistää veren hyytymistä. Miesten estrogeeni voi myös edistää gynekomastiaa, joka on rintojen suurentuminen, ja asettaa korkean estrogeenin omaavat miehet rintasyövän kehittymisriskiin.