Ensisijainen yhteys kahvin ja pahoinvoinnin välillä on, että kahvi ärsyttää vatsaa ja voi aiheuttaa vatsavaivoja, myös pahoinvointia. Jotkut ihmiset ovat herkempiä tälle vaikutukselle kuin toiset, ja ruoan nauttiminen ennen kahvin juomista voi vaikuttaa vatsaan liittyviin oireisiin. Kahvi voi myös nostaa verenpainetta ja aiheuttaa huimausta, jotka molemmat voivat myös aiheuttaa pahoinvointia, jos niitä ei hoideta. Joissakin tapauksissa juoma voi myös aiheuttaa närästystä ja ripulia.
Pahoinvointi liittyy usein kahvin kulutukseen, koska kahvi sisältää runsaasti kofeiinia. Tämä voi johtaa mahalaukun ärsytykseen, huimaukseen, sydämentykytykseen ja kohonneeseen verenpaineeseen. Jokainen näistä asioista voi johtaa pahoinvointiin joillakin ihmisillä, ja oireet voivat olla pahempia, kun niitä yhdistetään. Jotkut ihmiset sietävät kahvin kulutusta paremmin kuin toiset, ja monet tekijät voivat lisätä tai vähentää kahvin vaikutuksia.
Joillekin ihmisille kahvin juominen tyhjään vatsaan voi aiheuttaa pahoinvointia. Jos juoman hapan luonteen vaikutuksia puskuroimaan ei ole muuta sisältöä, vatsavaivoja voi esiintyä lisää. Tästä syystä monet ihmiset kokevat, että on hyvä idea juoda kahvia vain aterian yhteydessä tai suoraan ennen tai jälkeen aterian. Syöminen vähentää myös huimauksen tai huimauksen todennäköisyyttä ja voi auttaa pitämään verenpaineongelmat loitolla.
Kahvin korkea kofeiinipitoisuus voi myös johtaa kuivumiseen, mikä on merkittävä pahoinvoinnin riskitekijä. Kun juot kahvijuomaa, jotkut ihmiset huomaavat, että auttaa lasillinen vettä jokaista kahvikuppia kohti. Sen lisäksi, että vesi pitää nesteytettyä ja vähentää pahoinvoinnin riskiä, vesi voi myös lisätä energiaa ja lisäkahvia ei ehkä tarvita.
Haudutuksen vahvuus voi myös vaikuttaa pahoinvointioireisiin. Vaikka vaaleamman ja tummemman paahtamisen harrastajat ovat kiistelleet siitä, kummassa tyypissä on enemmän kofeiinia vuosien ajan, viimeaikaiset havainnot viittaavat siihen, että merkittävää eroa ei ole. Keiton vahvuus vaikuttaa ilmeisesti enemmän kahvityypistä ja kahvin tilavuudesta. Esimerkiksi, koska kevyesti paahdetut kahvipavut ovat kooltaan pienempiä kuin tumma paahto, vaalean paahtimen kauha sisältää enemmän kahvia kuin kauha tummaa paahtoa ja siten enemmän kofeiinia. Kummankin tyypin kofeiinipitoisuutta ja vahvuutta voidaan vähentää lisäämällä lisää vettä ja vähemmän kahvia tai lisäämällä maitoa sen laimentamiseksi edelleen. Kofeiinittoman kahvin juominen on myös hyvä vaihtoehto.
Lisäksi on olemassa kahviseoksia, jotka on erityisesti suunniteltu vatsavaivoille. Ne on suunniteltu olemaan lempeämpiä ruoansulatusjärjestelmässä ja aiheuttamaan vähemmän pahoinvointia ja muita oireita. Useimmat ruokakaupat kantavat niitä, ja eri valmistajilla voi olla omat sekoitukset.