Vaikka kaksisuuntaista mielialahäiriötä ja skitsofreniaa pidetään edelleen suurelta osin kahtena erillisenä psykiatrisena sairautena, ne liittyvät toisiinsa monin tavoin. Molemmat sairaudet kehittyvät yleensä myöhäisessä nuoruudessa tai varhaisessa aikuisuudessa. Geneettisten syy -tekijöiden on havaittu olevan hyvin samanlaisia molemmissa aivosairauksissa; Molemmat häiriöt esiintyvät usein samoissa perheissä. Joillakin ihmisillä diagnosoidaan molempien sairauksien oireita. Skitsofrenialla ja kaksisuuntaisella mielialahäiriöllä on myös yhteisiä oireita ja hoitoja.
Jotkut lääkkeet, jotka on määrätty sekä kaksisuuntaiseen mielialahäiriöön että skitsofreniaan, alentavat proteiinikinaasi C: n (PKC) määrää aivoissa. Tämän aivoproteiinin korkean tason uskotaan lisäävän molempiin sairauksiin liittyvien oireiden vakavuutta, kuten sellaisten asioiden kuulemista tai näkemistä, kilpailevia ajatuksia ja suurkokemuksia tai vääriä uskomuksia, jotka liittyvät henkilökohtaiseen voimaan. Skitsofrenian dysforiseen mielialaan kutsutuilla skitsofrenikoilla on usein voimakasta ärtyneisyyttä, ahdistusta ja masennusta, jotka ovat samankaltaisia kuin kaksisuuntaisilla tai maanis-masennuslääkkeillä yleensä masennuksen aikana. Jos sitä ei hoideta, sekä kaksisuuntaiset mielialahäiriöt että skitsofreniat käyttävät erittäin todennäköisesti huumeita tai alkoholia “itselääkityksenä”.
Suurin ero skitsofrenian ja kaksisuuntaisen mielialahäiriön oireiden välillä on mieliala. Kaksisuuntaista mielialahäiriötä pidetään mielialahäiriönä, jolle on ominaista kaksi äärimmäistä mielialaa: maaninen optimismi ja masentava toivottomuus. Erilaiset mielialat ovat niin vakavia, että ne häiritsevät kaksisuuntaisen mielialahäiriön jokapäiväistä elämää; usein määrätään mielialan stabilointiainetta, kuten litiumia. Skitsofrenikoilla ei ole kahta erillistä mielialajaksoa, vaan he kokevat jatkuvasti erilaisia oireryhmiä, jotka tunnetaan negatiivisina ja positiivisina; Näitä voidaan hallita psykoosilääkkeillä, kuten Haldolilla. Negatiivisia oireita on vaikeinta hoitaa lääkkeillä; ne näyttävät alitoimivilta, kuten tunteiden, puheen tai ilmaisun puutteelta, kun taas positiiviset skitsofrenian oireet toimivat liikaa, kuten äänten kuuleminen tai usko yli-inhimillisiin voimiin.
Henkilöllä voi olla molempia sairauksia tai ainakin päällekkäisiä oireita. Skitsoaffektiivinen diagnoosi viittaa henkilöön, jolla on skitsofrenia ja mielialahäiriö, kuten kaksisuuntainen mielialahäiriö tai vakava masennus. Suuri masennushäiriö eroaa kaksisuuntaisesta mielialahäiriöstä, koska siitä puuttuu maaninen vaihe. Kaksisuuntaisen mielialahäiriön ja skitsofrenian katsotaan liittyvän erityisesti toisiinsa. Tutkimukset ovat osoittaneet, että skitsofrenia saa ihmisen alttiimmaksi kaksisuuntaisen mielialahäiriön kehittymiselle.
Jos perheenjäsenillä on joko skitsofrenia tai kaksisuuntainen mielialahäiriö, se lisää riskiä sairastua yhteen tai molempiin sairauksiin. Perheellä, jolla on ollut yksi sairaus, on todennäköisesti myös toinen sairaus. Kaksisuuntainen mielialahäiriö ja skitsofrenia sisältävät geneettisiä komponentteja, jotka liittyvät molempiin aivosairauksiin.