Synnynnäisellä immuniteetilla tarkoitetaan niitä immuniteetin ominaisuuksia, jotka ovat läsnä syntymähetkellä ja siirtyvät geneettisesti vanhemmilta lapsille. Se koostuu paitsi ihosta ja limakalvoista, myös verisoluista, jotka ovat vastuussa taudinaiheuttajien, kuten bakteerien ja virusten, torjumisesta. Synnynnäinen immuniteetti eroaa hankitusta immuniteetista, jota ei ole syntyessä ja joka ilmenee, kun immuunijärjestelmä taistelee taudinaiheuttajaa vastaan ja luo vasta -aineita kyseistä taudinaiheuttajaa vastaan tulevan immuniteetin aikaansaamiseksi.
Luonnollisen immuunijärjestelmän ensimmäinen tärkeä osa on iho. Useimmat taudinaiheuttajat eivät voi tunkeutua ihoon, ellei vahinko ole vaarantanut esteen eheyttä. Keuhkot ja nenän kautta kulkeutuvat sappitoimet auttavat karkottamaan taudinaiheuttajia kehosta ennen kuin ne voivat aiheuttaa sairauksia. Kyyneleet, sylki, virtsa ja kuolleiden ihosolujen irtoaminen ovat kaikki synnynnäisiä immuunitoimintoja, jotka auttavat estämään taudinaiheuttajia tarttumasta kehoon. Ruoansulatuskanavan ja hengitysteiden limakalvojen limakalvot sieppaavat myös taudinaiheuttajia ennen kuin heillä on mahdollisuus tarttua kehoon ja aiheuttaa sairauksia.
Valkosolut ovat yksi luontaisen immuniteetin tärkeimmistä ominaisuuksista. Eri tyyppisiä valkosoluja ovat fagosyytit, makrofagit ja luonnolliset tappajasolut. Valkosolut palvelevat immuunijärjestelmää tunnistamalla ja poistamalla patogeeniset uhat. Nämä solut tappavat bakteereja ja viruksia.
Erilaisilla valkosoluilla on erilainen rooli synnynnäisessä immuunijärjestelmässä. Makrofagit kehittyvät, kun monosyytit, eräänlainen valkosolu, joka siirtyy tartunnan saaneisiin kudoksiin, suurenevat ja täyttyvät entsyymeistä, jotka auttavat niitä poistamaan bakteereja. Makrofagit jäävät kudoksiin infektiokohdassa poistamalla bakteereja ja vaurioituneita kuolleita soluja.
Muilla immuunijärjestelmän valkosoluilla on erilaisia kykyjä siepata, tappaa, niellä ja sulattaa taudinaiheuttajia. Basofiilit, eräs valkosolutyyppi, joka liittyy allergisiin reaktioihin, vapauttavat histamiinia, kun he kohtaavat allergeeneja. Histamiini lisää verenkiertoa tartunnan saaneisiin kudoksiin, mikä antaa muille valkosoluille enemmän mahdollisuuksia poistaa tunkeutuvia taudinaiheuttajia. Imusolmukkeista ja ihosta löytyvät dendriittisolut auttavat hajottamaan antigeenejä, jotta T-solut voivat tunnistaa ja poistaa ne. Luonnolliset tappajasolut voivat poistaa viruksia tappamalla tartuttamansa solut.
Luontaisen immuniteetin mukana tulee sisäänrakennettu kyky muodostaa uusia immuniteetteja tietyille patogeeneille. Synnynnäisen immuunijärjestelmän valkosolut ja veriproteiinit ovat vastuussa kehon kyvystä hankkia immuniteetti. Hankittu immuniteetti syntyy, kun valkosolut luovat vasta -aineita tiettyä taudinaiheuttajaa vastaan, mikä tekee yksilön immuuniksi kyseisen taudinaiheuttajan taudille tulevaisuudessa. Hankittu immuniteetti syntyy usein rokotusten avulla.