Jotkut yleisimmistä kuukautisten viivästymisen syistä ovat hormonaalinen epätasapaino, sairaudet, lääkkeiden muutokset ja vaihdevuodet tai raskaus. Liiallinen liikunta, nopeat painon muutokset, joko ylipaino tai alipaino ja huono ruokavalio voivat myös vaikuttaa epäsäännöllisiin kuukautisiin. Normaali kuukautiskierto on erilainen jokaiselle naiselle, koska jotkut naiset kuukautiset niin usein kuin 20 päivän välein ja toiset vain 35 päivän välein. Syklin pituus vaihtelee myös jokaisella naisella ja voi kestää kolmesta seitsemään päivään.
Hormonaalinen epätasapaino on yleinen syy syklin viivästymiseen. Yleinen hormonaalinen häiriö tunnetaan munasarjojen monirakkulaoireyhtymänä, ja se voi vaikuttaa epäsäännöllisiin kuukautisiin tai kuukautisten jäämiseen kokonaan. Emotionaalinen stressi, ahdistus, väsymys ja hormonikorvaushoito ovat yleisimpiä hormonitasoja häiritseviä tekijöitä. Häiriöitä voivat aiheuttaa myös vieraat aineet kehossa, kuten ympäristön saastuminen, kemikaalit, tupakansavu ja tiettyjen kosmetiikkatuotteiden liiallinen käyttö. Raskaus ja imetys ovat myös yleisiä kuukautisten viivästymisen syitä.
Huono ruokavalio, jossa on runsaasti tyydyttyneitä rasvoja, jalostettuja elintarvikkeita ja monia roskaruokia, voi riistää keholta tarvittavat ravintoaineet, joita se tarvitsee hormonitasojen tasapainottamiseksi. Epäterveelliset muutokset ruokavaliossa ja syömishäiriöt voivat johtaa nopeaan laihtumiseen tai nopeaan painonnousuun, jotka molemmat voivat häiritä kuukautiskiertoa. Ylipaino yleensä häiritsee hormoneja ja on siten tärkeä riskitekijä kuukautisten viivästymiselle. Liikunta voi auttaa ylläpitämään terveellistä painoa, mutta sitä tulisi tehdä maltillisesti, koska säännöllinen voimakas harjoittelu häiritsee myös sykliä.
Kuukautisten viivästyminen voi johtua myös tietyistä lääkkeistä, kuten ehkäisypillereistä, masennuslääkkeistä ja kortikosteroideista. Keholla voi kestää useita syklejä sopeutua uuteen hormonimäärään kehossa, kun nainen on käynnissä tai poistumassa ehkäisypillereistä. Muutokset muihin lääkkeisiin voivat myös johtaa kuukautisten viivästymiseen. Muita yleisiä syitä ovat akuutti tai pitkäaikainen sairaus, kuten kilpirauhasen sairaus, aivojen tai aivolisäkkeen kasvain, infektiot ja ennenaikainen munasarjojen vajaatoiminta.
Perimenopause on vaihe juuri ennen vaihdevuosia, jolloin keho alkaa vähentää hormonien tuotantoa. Tänä aikana syklit alkavat muuttua. Tästä seuraa usein kevyt tai raskas sykli, myöhäiset kuukautiset tai pitkät kuukautiskierrot.