Biopsialla varustetussa bronkoskopiassa on kaksi pääkomponenttia. Ensimmäinen on bronkoskopia, joka on yksinkertainen toimenpide, jossa lääkäri syöttää ohuen putken potilaan keuhkoputkiin, jotta hän voi nähdä mahdolliset vammat tai sairauden merkit. Jos lääkäri törmää epäilyttävän kudoksen poikki, ohut leikkauslaite voidaan syöttää bronkoskopiaputken läpi leikkaamaan kudospala biopsiaa varten. Biopsialla tehty bronkoskopia aiheuttaa potilaalle mahdollisimman vähän epämukavuutta ja antaa samalla arvokasta tietoa potilaan lääkintätiimille.
Lääkäri tietää harvoin, aikooko hän tehdä bronkoskopian biopsialla, ennen kuin hän arvioi visuaalisesti potilaan keuhkojen sisäpuolen. Epäilyttävät alueet, jotka näkyvät röntgensäteillä tai muilla ei-invasiivisilla skannauksilla, voivat osoittaa mahdollisen biopsian tarpeen, mutta lääkäri päättää yleensä leikata pienen osan potilaan keuhkoista vasta tutkittuaan alueen bronkoskoopilla . Jos alue näyttää siltä, että se voisi olla syöpä, lääkäri ottaa pienen palan potilaan kudosta analysoitavaksi laboratoriossa. Biopsiatun kudosnäytteen analyysi antaa potilaan lääketieteelliselle tiimille tietoa siitä, onko alue syöpä vai ei ja kuinka pitkälle syöpä voi kehittyä.
Useimmissa tapauksissa potilas on tietoinen keuhkoputkesta, vaikka monille annetaan lääkitystä rentoutumisen helpottamiseksi. Nenän tai kurkun ympärillä oleva alue on tunnoton paikallispuudutteella, ja lääkäri asettaa bronkoskoopin potilaan hengitysteihin. Kun bronkoskooppi työnnetään nenän kautta, lääkäri voi katsoa ylempiä hengitysteitä, kun taas suun käyttäminen mahdollistaa suuremman putken ja siten suurempien työkalujen käytön. Bronkoskoopin päässä on pieni valo ja kamera, joten lääkäri voi nähdä potilaan keuhkoihin.
Voidakseen tehdä bronkoskopian biopsialla lääkäri syöttää biopsia -instrumentit potilaan keuhkoihin bronkoskoopin kautta. Tällä tavalla lääkäri voi hankkia kudospalan biopsiaan heti nähdessään epäilyttävän alueen ilman, että hänen on suoritettava toinen toimenpide. Biopsialla tehdyn bronkoskopian jälkeen potilaalla voi olla kurkkukipu ja minimaalinen epämukavuus, jonka pitäisi selvitä muutaman päivän kuluessa.