Jotkut vaihtoehtoiset lääkärit käyttävät termiä “allopatia” kuvaamaan ihmisiä, jotka harjoittavat perinteistä tai “länsimaista” lääketiedettä. Koska tämä sana kehitettiin lähinnä epiteettinä perinteisten lääkäreiden loukkaamiseksi, on harvinaista nähdä tavallisia lääkäreitä kutsumassa itseään allopaateiksi. Jotkut lääkärit myös hylkäävät termin käytön, koska heidän mielestään se ei enää ole riittävä kuvaus lääketieteen käytännöstä.
Homeopatin perustaja Samuel Hahemann loi termin “allopatia”. Se on johdettu kreikkalaisista juurista ja tarkoittaa karkeasti “vastakkaista kärsimystä”. Hän käytti sanaa kuvatakseen usein ankaria ja joskus turhia hoitoja, joita tavanomaiset lääkärit käyttivät 19 -luvulla. Monet harjoittajat luottivat “huumorien” teoriaan, joka oli peräisin muinaisista kreikkalaisista, ja he uskoivat, että lääketieteellisille olosuhteille oli ominaista tietyn huumorin liiallinen tai vajaus. Verenlaskua, kuppia ja monia muita tekniikoita käytettiin huumorien tasapainon palauttamiseen, ja Hahemann uskoi näiden käytäntöjen olevan barbaarisia.
Hahemann halusi myös erottaa homeopatian selvästi perinteisestä lääketieteen käytännöstä. Hän väitti, että allopatia käsitti taudin oireiden hoitamisen eikä tilan perimmäistä syytä. Allopaattisen hoidon tavoitteena oli tuottaa vaikutuksia, jotka torjuisivat oireita, mutta eivät välttämättä päästä ongelman ytimeen. Homeopatia puolestaan oli yksittäiselle potilaalle räätälöityä hoitoa, jossa keskityttiin koko kehoon eikä abstrakteihin oireisiin.
Vaikka perinteisen lääketieteen käytäntö olisi ehkä ansainnut allopatian merkinnän, monet lääkärit uskovat, että näin ei enää ole. Esimerkiksi osteopaattiset lääkärit harjoittavat koko kehon lähestymistapaa lääketieteeseen, ja heidän pätevyytensä ovat lähes identtiset tavallisten lääkäreiden kanssa. Monet lääkärit tunnustavat myös koko kehon tarkastelun tärkeyden arvioitaessa potilaan terveyttä ja tarpeita, ja nykyaikainen lääketieteellinen hoito keskittyy yleiseen hyvinvointiin, ei vain reaktiiviseen reaktioon sairauden oireisiin.
Tämän termin epämiellyttävät vaikutukset menetetään joskus ihmisiin, jotka käyttävät sitä. Jotkut vaihtoehtoiset lääkärit viittaavat allopatiaan häikäisevillä sävyillä, kun he puhuvat asiakkaiden kanssa korostaakseen heidän tarjoamiensa hoitojen arvoa. Muut vaihtoehtoisen lääketieteen harjoittajat välttävät termiä, mutta tunnustavat, että lääketieteeseen on monia lähestymistapoja, ja jotkut jopa työskentelevät käsi kädessä tavanomaisten lääkäreiden kanssa. Esimerkiksi kiropraktikko voi työskennellä selkärangan asiantuntijan kanssa selkävammojen hoitamiseksi ja ehkäisemiseksi.