Aamupahoinvointi, krapula, hapan refluksi ja ahdistus ovat mahdollisia pahoinvoinnin syitä aamulla. Aamupahoinvointi vaikuttaa yli 50 prosenttiin raskaana olevista naisista, mutta samanlainen pahoinvointi tuntuu usein naisilta, jotka aloittavat ehkäisypillereitä. Krapulat johtuvat runsaasta alkoholinkäytöstä, ja tämän tilan monien yleisten oireiden joukossa on pahoinvointi. Pahoinvointi aamulla voi johtua myös hapon refluksoinnista. Stressin aiheuttama ahdistus, varsinkin jos pelkäät tapahtumaa, joka saattaa tapahtua myöhemmin päivällä, voi myös olla ongelman ydin.
Pahoinvointi gravidarum, joka tunnetaan myös nimellä aamupahoinvointi, uskotaan esiintyvän estämään raskaana olevia naisia syömästä elintarvikkeita, jotka voivat vahingoittaa sikiötä. Tämä vastenmielisyys tiettyihin elintarvikkeisiin voi myös suojella äitiä, koska hänen immuunijärjestelmänsä ei ehkä ole tasalla raskauden vuoksi. Aamupahoinvointi alkaa tyypillisesti aikaisin aamulla ja vähenee vakavasti koko päivän – ellei äiti syö tai haista ruokaa, joka voi aiheuttaa uuden sairauden. Lisäksi hormonaaliset ehkäisypillerit voivat aiheuttaa pahoinvointia, joka muistuttaa aamupahoinvointia lisääntyneen estrogeenipitoisuuden vuoksi. Kun näin tapahtuu, nainen saattaa tuntea pahoinvointia haistaessaan ruokia, joista hän nautti ja joita he käyttivät yleisesti.
Krapula on olennaisesti fysiologisia vaikutuksia, kuten pahoinvointia, päänsärkyä ja herkkyyttä valolle, jonka aiheuttaa runsas alkoholinkäyttö. Nämä krapulan sivuvaikutukset ovat hyvin yleisiä, jano ja herkkyys melulle. Vaikka yleisimpiä juomisen yön jälkeen, krapulapahoinvointi on mahdollista milloin tahansa vuorokauden aikana.
Tunnetaan myös nimellä gastroesofageaalinen refluksitauti (GERD). Normaalisti vatsan yläosa on suljettu, mutta eri asiat voivat vahingoittaa tai muuttaa tätä estettä. Närästys ja oksentelu ovat tavallisimpia oireita refluksi, mutta jotkut ihmiset, joilla on tämä sairaus, kokevat myös pahoinvointia. Se, kokeeko henkilö pahoinvointia aamulla, riippuu siitä, milloin hän viimeksi söi. Rintakipu ja liiallinen syljeneritys ovat muita harvinaisia oireita refluksoinnista.
Toinen mahdollinen pahoinvoinnin syy aamulla on ahdistus. Ahdistusta pidetään normaalina reaktiona stressiin, mutta joskus ahdistus voi olla liiallista tai ilman ilmeistä laukaisua. Jotkut ahdistuneisuuden oireet ovat pahoinvointi, rintakipu ja sydämentykytys. Joissakin tapauksissa ahdistuskohtauksia on sekoitettu sydänkohtauksiin oireiden vakavuuden vuoksi.