Somaattinen hypermutaatio (SHM) on mekanismi, jolla immuunijärjestelmä sopeutuu tunnistamaan antigeenejä, joita se ei ole aiemmin kohdannut. Tämä mekanismi on hallitseva menetelmä ihmisillä ja mahdollistaa immuunijärjestelmän solujen monipuolistaa reseptoreitaan edistämällä mutaatiota immunoglobuliinigeenien vaihtelevilla alueilla. Nämä alueet muodostavat vasta-aine-antigeeniä sitovia kohtia ja edistävät kunkin vasta-aineen spesifisyyskykyä, mikä mahdollistaa erityisen antigeenin tunnistamisen.
Kun vieras antigeeni, kuten mikrobi, joutuu kosketuksiin immuunijärjestelmän kanssa, B -solut tunnistavat sen tuntemattomaksi. Sitten B -solut aktivoidaan ja stimuloidaan lisääntymään. Tämän proliferaation aikana immunoglobuliinin vaihtelevan alueen DNA transkriboidaan ja transloidaan erittäin nopeasti, noin 105-106 kertaa nopeammin kuin normaali mutaatio. Tämä somaattinen hypermutaatio mahdollistaa nopean vasteen, joka on välttämätön tehokkaalle immuunijärjestelmälle.
Somaattinen hypermutaatio uskotaan saavutetuksi deaminoimalla sytosiiniemäs DNA: ssa aktivoinnin indusoiman deaminaasin (AID) avulla, muuttamalla se deoksisytidiinistä deoksiurasiiliksi ja tuloksena uusi DNA. Tämä uusi DNA sisältää urasiili-guaniini-yhteensopimattomuuden, koska urasiili esiintyy normaalisti RNA: ssa, jossa se on pariksi adeniinin kanssa, ja guaniini yhdistetään normaalisti DNA: n sytosiinin kanssa. Tämä mutaatio korjataan poistamalla se korkean tarkkuuden DNA-korjausentsyymillä, urasiili-DNA-glykosylaasilla (UNG2), mitä seuraa uusien DNA-juosteiden synteesi DNA-polymeraasilla. Tämä prosessi on kuitenkin altis virheille ja voi johtaa virheellisten nukleoemästen korvaamiseen alkuperäisessä deaminointipaikassa tai vierekkäisissä emäspareissa. Tämä luo “hot spotin”, joka on altis insertio- ja deleetiomutaatioille.
Somaattisen hypermutaation tulokset transkriboidaan ja käännetään, mikä johtaa suureen määrään B -soluja, joilla on erilaisia reseptoreita ja spesifisyyttä, hypermutoituneiden alueiden koodaamina. Ne B-solut, joilla on vasta-aineita, joilla on suurin affiniteetti antigeenille, joka alun perin stimuloi proliferaatiota, eriytyvät sitten plasmasoluiksi, jotka tuottavat vastaavan, affiniteettispesifisen vasta-aineen, sekä muistis B-soluiksi. Nämä erilaistumiset ja affiniteettikypsyminen mahdollistavat myöhemmin immuunijärjestelmän tuottaa suuremman ja tehokkaamman vasteen, jos antigeeni havaitaan tulevaisuudessa.
Somaattinen hypermutaatio tapahtuu yksittäisissä immuunisoluissa, joten se välittyy vain tietyn solulinjan sisällä. Lisäksi mutaatioita ei siirretä jälkeläisille. Ongelmia voi kuitenkin ilmetä, koska somaattiseen hypermutaatioon liittyy myös soluja, jotka valitsevat automaattisesti organismien omia soluja vastaan. Jos tässä prosessissa epäonnistuu, autoimmuunivaste voi aiheutua.