Mikä on kromosomikävely?

Kromosomikävely on paikannuskloonausmenetelmä, jota käytetään tietyn alleelin löytämiseen, eristämiseen ja kloonaamiseen geenikirjastossa. Alleeli on geeni tietylle geneettiselle piirteelle, joka siirtyy aikuisilta jälkeläisilleen, kuten alleeli ruskeille silmille silmien värin geenissä. Joskus yksittäisen alleelin likimääräinen sijainti deoksiribonukleiinihappojoukossa (DNA) voi olla tiedossa. Tietyn alleelin eristämiseksi geneettisesti tarttuvalle taudille kromosomikävely voi joutua tutkimaan haluttua näytettä kartoitamattomassa DNA -sekvenssissä aiemmin kartoitettujen sekvenssien ulkopuolella.

Tietyn taudigeenin löytämiseksi kävely alkaa lähimmästä, jo tunnistetusta geenistä, joka tunnetaan merkkigeeninä. Kukin peräkkäinen geeni sekvenssissä testataan toistuvasti päällekkäisyyksien suhteen ja kartoitetaan niiden tarkan sijainnin suhteen sekvenssissä. Lopulta geenien läpi käveleminen saavuttaa mutanttigeenin kartoittamattomana sekvenssinä, joka sitoutuu kyseisen sairauden geenifragmenttiin. Kun geeni on kloonattu, sen toiminta voidaan tunnistaa täysin. Koko tämän prosessin aikana tehdään testejä kunkin peräkkäisen kloonin ominaisuuksien täydelliseksi tunnistamiseksi ja niiden sijainnin kartoittamiseksi tulevaa käyttöä varten.

Ennen kromosomikävelyä tehdään lähes puoli tusinaa sijaintikloonaustestiä kaventamaan mahdollisimman paljon tiettyjä geneettisiä sekvenssejä, jotka voivat sisältää halutun sairauden mutanttigeenin. Kun markkerit kartoittamattoman todennäköisen sekvenssin kummaltakin puolelta on löydetty, kromosomikävely voi alkaa yhdestä markkereista. Kunkin peräkkäisen kloonin testaus on monimutkaista, aikaa vievää ja vaihtelee lajeittain. Kasvisairauksiin liittyville geeneille on erilaisia ​​testejä kuin ihmisen geenikirjastossa oleville geeneille.

Paikallinen kloonaus käyttää geneettisiä markkereita, joiden tiedetään asuvan tiettyjen sairauksien yksilöiden kromosomeissa. Nämä tunnettujen yhteisten piirteiden tietokannat mahdollistavat testauksen, jota voidaan käyttää yksilöimään yksilöitä, joilla voi olla tai ei ole tiettyjä resessiivisiä geenejä taudille, jota ei ole vielä esitetty. Kromosomikävely yhdessä kaikkien muiden ennen kromosomikävelyä suoritettujen testien kanssa edellyttää poikkeuksellisen hyvin varustettuja laboratorioita, joissa voidaan suorittaa kaikki kloonausvaiheet, tutkimukset ja löydettyjen mutaatioiden analyysi.