Mekaaninen taso on mikroskoopin kiinnike, joka pitää diat paikallaan ja antaa käyttäjälle mahdollisuuden hallita tarkasti sijaintiaan. Nämä laitteet voivat olla hyödyllisiä diojen käsittelyssä suurilla suurennuksilla ja herkissä toiminnoissa, joissa sijainti on erittäin tärkeää. Lisälaitteita voidaan käyttää mikroskoopin perusvaiheen, litteän alustan, jossa on pidikkeet, muuttamiseksi mekaaniseksi vaiheeksi. Joissakin uusissa malleissa on mekaaniset vaiheet tai lisävarusteet. Erityisesti suuritehoiset mikroskoopit saattavat tarvita mekaanisia vaiheita toimiakseen parhaiten.
Jos haluat käyttää mekaanista lavaa, kuljettaja asettaa liukumäen lavalle ja kiinnittää sen paikalleen. Okulaareja voidaan säätää halutun tarkennuksen ja suurennuksen aikaansaamiseksi, jotta käyttäjä voi katsella diaa. Sen sijaan, että siirtäisi diaa manuaalisesti katsomaan eri aluetta, käyttäjä ohjaa mekaanista vaihetta vetääkseen dia eri alueelle. Monet toimivat säädettävillä nuppeilla. Käyttäjien on ehkä ensin kokeiltava, koska dian suunta voi olla hämmentävä, kun he katsovat okulaareja.
Erittäin suurella suurennuksella käyttäjä saattaa haluta pystyä tekemään mikromoottorin nähdäkseen dian eri osan. Manuaalinen uudelleensijoittaminen ei tarjoa käytettävissä olevaa tarkkuutta, kun taas mekaaninen vaihe tarjoaa. Käyttäjä voi merkitä X- ja Y -akselin koordinaatit lavalle varovasti siirtääkseen diaa. Diaa voidaan siirtää skannaamalla mekaanisilla säätimillä, jolloin käyttäjä voi etsiä jotain erityisen kiinnostavaa ja pysähtyä tutkimaan sitä tarkemmin.
Liukumäkien edestakaisin, ylös ja alas siirtämisen lisäksi mekaaninen porras voi tarjota kulmasäädön. Joskus on tarpeen kallistaa dioja tai näytteitä. Teknikko voi liikuttaa nuppeja muuttaakseen kulmaa ja tutkia kiderakennetta tai vastaavaa ilmiötä eri näkökulmasta. Tällaiset mekaaniset vaiheet ovat monimutkaisempia ja niitä voi olla vaikeampi oppia käyttämään, joten ne asennetaan yleensä vain tarvittaessa.
Tietokoneohjatut mikroskoopit voivat antaa teknikon ohjata mekaanista vaihetta ohjelmoiduilla kommenteilla tai handsfree-tekniikalla. Sekvenssejä voidaan syöttää tietokoneeseen, joka suorittaa tarvittavat säädöt, ja sitä voidaan joissakin tapauksissa ohjata myös suullisilla määräyksillä. Tästä voi olla hyötyä esimerkiksi demonstraatioiden kaltaisissa aktiviteeteissa, joissa tiedemies voi haluta keskittyä tietojen esittämiseen. Käyttäjä voi ohjelmoida asetukset etukäteen siirtääkseen diaa keskustelemalla eri ominaisuuksista, kun ne tulevat näkyviin.