Mikroskooppeja on kahdenlaisia. Useimmat ihmiset tuntevat katseensa näytteeseen alhaalta tulevan valonlähteen kanssa, ja sitä kutsutaan pystysuoraksi mikroskoopiksi. Käänteinen mikroskooppi katsoo näytettä ja valonlähde tulee ylhäältä.
Käänteiset mikroskoopit keksittiin ensimmäisen kerran vuonna 1850 Tulanen yliopiston J. Lawrence Smithin toimesta ja debytoi Lontoon maailmannäyttelyssä vuonna 1852. 20 -luvun alussa niitä alettiin käyttää elävien solujen, erityisesti vesieliöiden, tarkkailuun. Sitä käytettiin myös raskasmetallien, kuten raudan ja teräksen, analysointiin ennen toista maailmansotaa.
Käänteisestä mikroskoopista on eniten hyötyä, kun tarkastellaan raskaita esineitä tai niitä, joihin painovoima vaikuttaa suuresti. Materiaalinäytteet, kuten metalli, voivat olla suuria ja raskaita. Ne vaativat suuria pysähdysalueita, jotka käänteiset mikroskoopit mahdollistavat.
Materiaaleihin, joihin painovoima vaikuttaa suuresti, kuuluvat elävät solut ja vesieläimet, jotka pyrkivät kerääntymään ja kerääntymään näytesäiliöiden pohjalle. Käänteinen mikroskooppi katsoo näytettä alhaalta, mikä helpottaa organismien näkemistä helposti. Sen avulla käyttäjät voivat myös nähdä näytteet luonnollisemmassa ympäristössä kuin tavallinen lasilevy. Petri -astiat mahdollistavat näytteiden suuremman liikkeen, ja niitä käytetään yleisesti käänteisten mikroskooppien kanssa.
Tämäntyyppinen mikroskooppi on suunniteltu uudelleen ja parannettu vastaamaan tiettyjä käyttötarkoituksia. On olemassa vaiheita, jotka on tehty erityisesti sellaisille prosesseille kuin inkubaatio ja koeputkihedelmöitys. Nenäkappaleet on tehty suuremmiksi ja käännettäviksi, mikä helpottaa tutkijoiden tunnistamista ja kiertämistä. Niistä on tehty myös raskaampia ja tukevampia, mikä mahdollistaa vähemmän tärinää ja helpottaa havaitsemista.
Käänteisiä mikroskooppeja on kahdenlaisia. Rutiininomainen käänteinen mikroskooppi on pieni ja tulee pienen ja keskisuuren tehon asetuksiin. Niitä voidaan käyttää kodeissa ja pienissä laboratorioissa kouluissa. Niiden havainnointikyky on rajallinen, koska ne eivät yleensä salli tarkennusta ja niiden tehon suurennus on suhteellisen pieni.
Tutkittu käänteinen mikroskooppi on raskaan tehon asetuksissa ja voi mahdollistaa erittäin tarkan tarkennuksen. Suurin haittapuoli heille on, että ne ovat erittäin kalliita ja niitä käyttävät yleensä vain yliopistot ja lääketieteelliset laitokset. He pystyvät yleensä sijoittamaan videokameroita ja televisioita auttamaan tutkimusdokumentaatiossa. Käänteisen mikroskoopin parannukset 20- ja 21 -luvuilla ovat mahdollistaneet sen olevan olennainen osa pitkälle edistynyttä tieteellistä tutkimusta.