On vain vähän tai ei lainkaan todisteita siitä, että polygrafitestit voivat saada valehtelijat kiinni, ja melko vähän todisteita sitä vastaan. Monikuvat toimivat pääasiassa mittaamalla ihon johtavuutta, joka piikittää ylöspäin hikeän läsnä ollessa. Mutta kokeneet valehtelijat eivät hikoile. Itse asiassa monet Yhdysvaltain hallituksen kaksoisagentit ja vakoojat ovat kiertäneet vaivattomasti lukuisia polygrafikokeita. Muut polygrafilla mitatut muuttujat, mukaan lukien sydämenlyönnin ja verenpaineen muutokset, voidaan myös helposti väärentää.
Kuuluisa CIA: n Neuvostoliiton vakooja Aldrich Ames läpäisi polygrafitestit useaan otteeseen. Hän kysyi neuvostoliiton ohjaajalta, mitä tehdä näille kokeille, ja ohjaaja vain nauroi: “Älä huoli, ne eivät toimi.” Hän oli oikeassa.
Richard Nixon sanoi kerran kuuluisasti: “En tiedä mitään valheenilmaisimista, paitsi että ne pelottavat ihmisiä.” Lainvalvontaviranomaiset ja poliisit, jotka käyttävät polygrafikoneita, eivät ole tiedemiehiä – heille vain kerrotaan, että konetta voidaan käyttää valheiden havaitsemiseen, kun heillä on muutaman viikon koulutus, ja he voivat lähteä iloiselle tielleen ilman syytä epäillä, mitä he ovat kertoi. Valitettavasti negatiiviset tulokset tieteellisesti virheellisistä valheenilmaisintesteistä voivat merkitä jonkun elämän ja pilata heidän uransa. Väärät positiiviset tulokset polygrafikokeissa ovat yleisiä.
Itse asiassa polygrafitestit ovat vielä ankarampia rehellisille ihmisille, jotka eivät ole tottuneet sanansa kyseenalaistamiseen. Kokeneet valehtelijat, jotka on koulutettu piilottamaan ilmeitä ja näyttämään rauhallisilta koko ajan, ovat ylivoimaisia testin läpäisemisessä. Valtion virastot saavat väärän turvallisuuden tunteen, kun polygrafitestit tulevat pakollisiksi, mikä johtaa laiskuuteen muilla turvallisuusalueilla. Tämä on erittäin hyödytöntä alueilla, joilla virkamiehille annetaan arkaluonteisia kansallisen turvallisuuden tietoja ja joihin he luottavat.
Polygraafitesti perustuu pohjimmiltaan kyseenalaiseen tieteelliseen oletukseen-että valehtelemisen/totuuden kertomisen ja fysiologisten tilojen välillä on yleisesti johdonmukainen korrelaatio. Perusteelliset tutkimukset ovat osoittaneet, että sitä ei ole.