Nykyisen tekniikan avulla on mahdotonta arvioida tarkkaa bakteerilajien määrää. Jotta ihmiset todella pääsisivät lähelle tavoitemäärää, he tarvitsevat koneen, joka pystyy käsittelemään maaperää, vettä ja kiviä suuria määriä, eristämään bakteerit elinympäristöstään ja sitten sekvensoimaan mahdollisimman monen bakteerin genomit näytteessä.
Nykyään tämä on mahdotonta ottaa huomioon, että bakteer genomin sekvensointi maksaa puoli miljoonaa Yhdysvaltain dollaria ja kestää muutaman kuukauden. Vaikka kustannukset pienenevät biljoonaa kertaa, maaperässä on niin paljon mikrobeja, että niiden luokittelu tällä tavalla olisi kohtuuttoman kallista.
Kokonaisten genomien sekvensoinnin sijaan bakteeritutkimukset käyttävät katkelmia eri lajien erottamiseen. Tämä on kustannustehokkaampaa kuin koko genomin sekvensointi. Eräässä tutkimuksessa havaittiin 20,000 bakteerilajia 1 litrassa (noin 1 litraa) merivettä.
Toinen lähestymistapa bakteerien määrän määrittämiseen näytteessä on käyttää tekniikkaa, jota kutsutaan DNA: n uudelleen assosiaatioksi. DNA: n uudelleen yhdistämisessä tutkijat käyttävät kemikaaleja “purkamaan” kaksoiskierukan kaksi juosetta bakteeri-DNA: han ja sekoittamaan ne sitten. Yhteensopivat DNA-juosteet kytkeytyvät uudelleen toisiinsa. Mitä kauemmin yhdistämisprosessi kestää, sitä enemmän lajeja on näytteessä. Näitä ajan mittauksia voidaan käyttää arvioimaan bakteerien biologista monimuotoisuutta meressä tai maaperässä.
Kun tätä tekniikkaa sovellettiin maaperänäytteeseen 1990 -luvun lopulla, löydettiin 16,000 0.035 lajia. Tämä tekniikka sisälsi kuitenkin oletuksen, että eri bakteerilajien populaatiot olivat suunnilleen samanlaisia, mutta tämän tiedetään nyt olevan väärä. Jason Gansin päivitetyn tutkimuksen mukaan noin miljoona bakteerilajia on 1 unssia (XNUMX grammaa) maaperää kohden. Vaikka vain muutama bakteerilaji hallitsee maaperää, siellä on valtava määrä vähäisiä lajeja.
Toinen lähestymistapa on käyttää lajien monimuotoisuuskäyrien matemaattisia malleja ekstrapoloimaan lajien kokonaismäärä tietyssä näytteessä muutamien huippulajien runsaudesta saadun tiedon perusteella. Curtisin, Sloanin ja Scannelin vuonna 2002 julkaisussa “Prokaryoottisen biologisen monimuotoisuuden ja sen rajojen arviointi” arvioitiin, että valtameribakteeritaksonien määrä on alle 2 miljoonaa, maaperän taksonien määrä vähintään 4 miljoonaa ja ilmakehän taksonien määrä vähintään 4 miljoonaa. Tässä tutkimuksessa oletettiin, että bakteerien monimuotoisuus grammassa maaperää oli vain 6,400 – 38,000 grammaa kohden, mikä on paljon vähemmän kuin DNA: n uudelleen assosiaatiotutkimuksessa.
Tällä hetkellä arviot lajien kokonaismäärästä vaihtelevat noin 10 miljoonasta miljardiin, mutta nämä arviot ovat alustavia ja saattavat poiketa monista suuruusluokista. Vertailun vuoksi on luultavasti 10–30 miljoonaa eläinlajia, joista suurin osa on hyönteisiä. Tieteellisesti tunnustettuja eläinlajeja on noin 1,250,000 300,000 XNUMX. Tunnettuja kasvilajeja on lähes XNUMX XNUMX.