Missourin kompromissiin sisältyi useita Yhdysvaltain kongressin toimia vuosina 1820-1821 tasoittaakseen vapaiden valtioiden ja orjavaltioiden määrää unionissa. Kun Missouri anoi valtioneuvostoa vuonna 1819, vapaiden valtioiden ja orjien määrä oli sama. Käytiin keskustelua siitä, pitäisikö Missouri hyväksyä orjuuden sallineeksi tai orjuutta kieltäväksi osavaltioksi. Kongressi päätyi lopulta kompromissiin, jolloin Maine tuli vapaaksi valtioksi ja Missouri orjavaltioksi pitäen jakelu tasaisena. Missourin kompromissi määritteli myös, miten orja ja vapaa valtio -keskustelua käsitellään tulevaisuudessa, jotta vältetään lisäkeskustelu.
Ennen Missourin hakeutumista valtiollisuuteen 11 valtiota eivät sallineet orjuutta ja 11 valtiota. Valtiot, joissa oli orjuutta, suhtautuivat lujasti elämäntapansa säilyttämiseen, kun taas Pohjois -osavaltioiden hävittäjät olivat yhtä intohimoisia halustaan orjien vapauttamista. Sekä vapailla että orjavaltioilla oli tasavertainen edustus senaatissa. Vapaiden valtioiden väestö oli kuitenkin suurempi, mikä antoi ryhmälle suuremman edustuksen edustajainhuoneessa.
Kun eteläiset asuttivat Missourin, oli odotettavissa, että valtio haluaisi sallia orjuuden. Vuonna 1819 New Yorkin edustajainhuoneen jäsen James Tallmadge ehdotti tarkistusta, jolla pyrittiin estämään orjien tuonti Missourin alueelle ja orjien vapauttaminen alueella. Toimenpide hyväksyttiin edustajainhuoneessa, mutta ei senaatissa.
Missourin kompromissi salli orjuuskysymyksen molemmin puolin saada jotain, mitä he halusivat. Vuonna 1820 Pohjois -Maine osavaltio hyväksyttiin unioniin vapaana valtiona. Missouri puolestaan päästettiin orjuuden sallivaksi valtioksi. salli orjien ja vapaiden valtioiden lukumäärän jälleen olla yhtä edustettuina kongressissa.
Sen lisäksi, että Missourin kompromissi toi unioniin yhden orjavaltion ja yhden vapaan valtion, se käsitteli myös sitä, miten valtion orjuusasiat tulisi käsitellä tulevaisuudessa. Kompromissin mukaan loppuosa Louisianan ostoalueesta Missourin etelärajan pohjoispuolella olisi orjatonta. Toimenpiteessä pyydettiin myös vapaiden valtioiden ihmisiä palauttamaan pakenevat orjat omistajilleen.
Tuolloin parlamentin puhemiehenä toiminut Henry Clay on ansioitunut auttamaan Missourin kompromissin johtoasemassa. Lain allekirjoitti lopulta presidentti James Monroe. Laki ei lopettanut pysyvästi orjuuskeskustelua, ja Missourin kompromissi kumottiin lopulta Kansas-Nebraska-lailla vuonna 1854, jolloin Kansasin ja Nebraskan uudet siirtokunnat saivat päättää itsenäisesti, sallivatko orjuuden rajojensa sisällä vai eivät. .