Rasvahappojen toisessa päässä on hapan ryhmä, joka on yhdistetty hiilivetyketjuun, joka hylkii vettä. Ne ovat erittäin tärkeitä solukomponentteja, jotka palvelevat rakenteellisia rooleja kalvokomponenteina, signaloivat rooleja hormoneina ja energianlähteinä aineenvaihdunnan polttoaineena. Ihminen saa ruokavaliostaan monenlaisia rasvahappoja, mutta kehon on syntetoitava useita erilaisia rasvahappoja. Rasvahapposynteesiä välittää nisäkkäillä suuri proteiinipari, joka sisältää useita erilaisia entsyymejä, jotka toimivat yhdessä ja joita kutsutaan rasvahapposyntaasiksi (FAS).
Tämä entsymaattinen järjestelmä on erittäin monimutkainen ja suorittaa useita erilaisia biokemiallisia reaktioita, jotka kaikki johtavat rasvahapon synteesiin. Rasvahapposynteesin perusreaktio on yhdistää kahdesta hiiliyksiköstä koostuvat molekyylit pidemmiksi ketjuiksi rasvahappojen muodostamiseksi. Nisäkkäiden muodostama rasvahappo on 16 hiiltä pitkä palmitiinihappoyhdiste, joka tunnetaan myös nimellä C16. Palmitiinihappo on tyydyttynyt rasvahappo, eli se ei sisällä kaksoissidoksia. Tämän yhdisteen biosynteesi tapahtuu sytosolissa, eikä se liity kalvoihin.
Palmitiinihapon synteesi vaatii enemmän kuin vain kaksi hiilihydraattihappoesiasetta ja rasvahapposyntaasia. Se vaatii myös kofaktorin, joka on ei-proteiinikomponentti, joka liittyy löyhästi entsyymiin. Kofaktori CoA on rikkiä sisältävä yhdiste, joka on mukana kaikissa kemikaaleissa, jotka toimivat hiililähteinä rasvahappoketjussa. Kasvavaan rasvahappoketjuun lisättävien kahden hiiliyksikön lähde on kolmen hiilen kofaktori malonyyli-CoA, joka on valmistettu kahden hiilen yhdisteestä asetyyli-CoA.
Rasvahapposyntaasi on ensin aktivoitava kosketuksessa asetyyli-CoA: n kanssa. Tämän reaktion jälkeen FAS pidentää peräkkäin syntyvää rasvahappoketjua käyttämällä malonyyli-CoA: sta luovutettuja hiiliryhmiä. Tämä prosessi vaatii sarjan erilaisia kemiallisia reaktioita. Kun ketju kasvaa, se siirtyy entsyymistä toiseen, kunnes se on saavuttanut lopullisen 16 hiilen pituutensa. Sitten se vapautuu proteiinista.
Rasvahapposyntaasia on kahdenlaisia. FAS Type I on nisäkäs, joka tuottaa vain palmitiinihappoa käyttämällä suurta proteiiniparia, joista jokainen sisältää useita erilaisia entsyymejä. Sitä vastoin bakteerit ja kasvit käyttävät tyypin II FAS -tekniikkaa. Tässä monientsyymikompleksissa on yksittäisiä entsyymejä erillisinä proteiineina, jotka ryhmittyvät yhteen. Tyypin II kompleksi voi tuottaa muita rasvahappotyyppejä, mutta se ei ole yhtä tehokas kuin nisäkkään tyypin I FAS.