Tietokone voidaan alustaa eri tavoilla, useimmiten riippuen käyttöjärjestelmästä ja siitä, kuinka perusteellinen uudelleenkirjoituksen on oltava. Useimmissa olosuhteissa, järjestelmästä riippumatta, käynnistyslevy on tarpeen tietokoneen alustamiseksi. Windows® -käyttöjärjestelmässä käyttäjän on painettava F12 -näppäintä käynnistettäessä, kun taas Mac OS® -käyttäjät voivat käyttää Levytyökalua. Yleensä on suositeltavaa käyttää useita tunteja tietokoneen alustamiseen ja käyttöjärjestelmän uudelleenasentamiseen.
Alkuperäisen asennuslevyn käyttäminen on tyypillisin tapa alustaa tietokone, jossa on Windows® -versio. Tietokone on käynnistettävä uudelleen, kun levy on asetettu asemaan. F12 -näppäimen painaminen estää tietokoneen käynnistymisen normaalisti ja antaa käyttäjän kertoa tietokoneen käynnistyvän asennuslevyltä kiintolevyn sijaan. Kun levy on valittu käynnistyslaitteeksi, tietokone käynnistyy ja sallii käyttäjän alustaa uudelleen.
Luettelo osioista näytetään käyttäjälle, kun tietokone käynnistyy Windows® -asennuslevyltä. Useimmissa Windows® -tietokoneissa on yksi tai kaksi osiota; jos tietokoneessa on kaksi osiota, toinen on usein paljon suurempi kuin toinen. Tässä tapauksessa pieni osio on yleensä palautus- tai varmuuskopio -osio. On vain tarpeen keskittyä suureen osioon uudelleen alustamisen aikana. Prosessi käynnistetään nuolinäppäimillä ja enter -näppäimillä, kun oikea osio on tunnistettu uudelleen muotoiltavaksi.
Mac OS® -käyttöjärjestelmää käyttävät tietokoneet voidaan alustaa uudelleen avaamalla Levytyökalu, valitsemalla levy ja napsauttamalla Poista. Käynnistyslevyn alustamiseksi tietokone on käynnistettävä asennuslevyllä. Kuten Windows® -tietokoneissa, tärkeät tiedot on varmuuskopioitava ennen jatkamista. Ellei levyä käytetä johonkin erityiseen, alustusasetukset toimivat yleensä parhaiten.
Joskus Mac OS® -tietokoneen alustamiseen on kaksi vaihtoehtoa: korkea ja matala. Korkean tason alustus on nopea, yleensä alle pari minuuttia, ja se on suunniteltu vianetsintään. Matalan tason alustus voi kestää paljon kauemmin, mutta se myös poistaa kaikki tiedot sen sijaan, että ne lopulta kirjoittaisivat uudelleen, kun tilaa rajoittuu.
Käyttöjärjestelmän uudelleenasennus voi kestää useita tunteja. Tärkeiden päivitysten ja suosikkisovellusten asentaminen voi myös viedä huomattavan paljon aikaa. Jos mahdollista, on parasta varata koko päivä varmistaaksesi, että tietokone toimii uudelleen tarvittaessa.