Hakukoneiden yksityisyys on monien ihmisten ja yritysten huolenaihe. Yritykset voivat käyttää hakukoneen tuloksia moniin eri tarkoituksiin aina käyttäytymiskohdistuksesta yksinkertaisiin hakutilastotietoihin. Yksinkertaisella tasolla henkilö voi käyttää jonkun toisen tietokonetta ja tarkistaa, mitä on etsitty, olettaen, että tietokoneen omistaja ei ole poistanut tallennettuja selaustietoja. Tyypillisesti hakukoneiden yksityisyyden loukkauksia ei ole tarkoitettu haitallisiksi; usein niitä käytetään vain sen varmistamiseen, että mainokset, jotka joku näkee verkossa, liittyvät hänen etuihinsa.
Yksilöillä voi olla monia eri syitä haluta pitää Internet -haut salassa. nämä ihmiset ovat yleensä erittäin kiinnostuneita hakukoneiden yksityisyydestä. Joskus syyt ovat yksinkertaisesti henkilökohtaisia. Tämä voi sisältää kaikkea pornografiasta taloudellisiin tai terveystietoihin. Toiset ihmiset pelkäävät, että joku löytää heidän henkilökohtaiset tietonsa, kuten nimen, osoitteen, puhelinnumeron tai sosiaaliturvatunnuksen hakukoneen tulosten kautta. Olipa heidän motivaationsa mikä tahansa, monet ihmiset pitävät hakukoneiden yksityisyyttä tärkeänä.
Hakukoneen tietoja voidaan joissakin tapauksissa käyttää haitallisesti, mutta tämä ei aina pidä paikkaansa. Useimpien suosittujen hakukoneiden syöttämät tiedot eivät yleensä ole yksityisiä. Hakukoneita käyttävät yritykset voivat käyttää hakulausekkeita ja käyttää niitä mainontaan ja tutkimukseen. Yleensä tämä ei johda mihinkään muuhun kuin kohdemainoksiin. Joissakin harvinaisissa tapauksissa väärät ihmiset voivat kuitenkin saada käsiinsä hakulausekkeisiin ja joskus nähdä yksityisiä tietoja, jotka yksilöt ovat syöttäneet hakukoneisiinsa.
Hakukoneet eivät aina ole täysin suojattuja, joten niihin ei yleensä ole järkevää syöttää yksityisiä tietoja. On olemassa useita muita menetelmiä, joita ihmiset käyttävät hakukoneiden yksityisyyden varmistamiseen. Yksi mahdollinen vaihtoehto on käyttää julkista tietokonetta; jos hakulauseketta ei voida yhdistää yksittäiseen henkilöön, se ei ole erityisen merkittävä. Jotkut sivustot tarjoavat työkaluja, joilla voidaan taata nimettömyys, kun etsitään erityisen arkaluonteisia tietoja. Erilaisten hakukoneiden käyttö voi estää yksittäisiä hakukoneita kehittämästä yksittäisen käyttäjän täydellistä profiilia.