Monet yritykset harkitsevat Linuxin valitsemista yrityksille sen mukaan, mitä sovelluksia he tarvitsevat. Oli kyseessä sitten back-end-toiminto tai korkean teknologian yritys, joka tarvitsee käyttöjärjestelmän uusimmille laitteilleen, Linux on monipuolinen käyttöjärjestelmä useilla alustoilla. Vaikka monet yritykset arvostavat Microsoft Windows®- ja Macintosh® -järjestelmien kaltaisia tuki- ja ohjelmistotuotteita, Linux tarjoaa useita mahdollisia etuja, kuten hinnan, turvallisuuden ja monipuolisuuden. Miinuksia ovat rajoitettu laitteistojen saatavuus ja hyvin vähän teknistä tukea, mikä voi olla suuria ongelmia, jos yrityksen oma IT -osasto ei ole tehtävänsä tasalla.
Yksi tärkeimmistä eduista Linuxin käyttämisessä yrityksissä liittyy kustannuksiin. Käyttöjärjestelmät eivät ole markkinoiden kalleimpia ohjelmistotyyppejä, mutta eivät yleensä myöskään halpoja. Toisaalta Linux on ladattavissa ilmaiseksi Internetistä. Se on saatavana myös CD -levyllä nimellismaksulla. Tämä voi olla tärkeä näkökohta aloittaville yrityksille tai niille, joilla on paljon työasemia käyttöjärjestelmien varustamiseen.
Toinen etu Linuxin käytössä yrityksille on sen turvallisuus. Vaikka muissa käyttöjärjestelmissä voi olla joitain suuria tietoturva -aukkoja, Linuxia pidetään suhteellisen turvallisena järjestelmänä. Tämä tarkoittaa, että järjestelmä ei ole yhtä altis virusinfektioille, mikä voi mahdollisesti vähentää seisokkeja. Tuotanto ei siis vaarannu, koska järjestelmä on luotettavampi.
Monipuolisuus on toinen syy, miksi jotkut yritykset voivat valita Linuxin yrityssovelluksiin. Haluaako yritys käyttää sitä myyntisovelluksissaan, tekstinkäsittelyssä tai jopa myymiensä tuotteiden sisällä, se voidaan tehdä. Esimerkiksi jotkin GPS -yksiköt toimivat Linux -käyttöjärjestelmällä. Monet ihmiset saattavat tuntea tietyt järjestelmän näkökohdat eivätkä edes ymmärrä sitä.
Tästä huolimatta suuri rajoitus Linuxin käyttämiselle yrityksissä on saatavilla olevassa ohjelmistossa. Vaikka vanhemmat ohjelmistot toimivat yleensä Linux -järjestelmässä ilman ongelmia, saattaa olla muitakin uudempia ohjelmistotyyppejä, jotka eivät toimi. Yritys, joka on tottunut käyttämään eri käyttöjärjestelmää, ei välttämättä löydä kaikkia ohjelmistojaan yhteensopiviksi Linux -järjestelmien kanssa. Tämä voi aiheuttaa enemmän kustannuksia, jos ohjelmisto on vaihdettava.
Toinen Linuxin käytön epäkohta on teknisen tuen alue. Suuremmat yritykset, joilla on oma tietotekniikkaosasto, eivät ehkä pidä tätä haittana. Pienemmät yritykset voivat kuitenkin luottaa enemmän käyttöjärjestelmän valmistajan ohjelmistotukeen. Linux ei tarjoa tuotteelle suurta tukea.