Joidenkin eläinlääkäreiden ja eläinasiantuntijoiden mukaan teepuuöljy voi olla myrkyllistä koirille, kun se nautitaan tai imeytyy ihon läpi. Lisäksi epäillään, että teepuuöljyn käyttö koirille voi myös aiheuttaa maksavaurioita. Teepuuöljyn vahingossa nieleminen voi aiheuttaa ruoansulatuskanavan oireita myös koirilla. Lisäksi on raportoitu koirista, jotka kärsivät neurologisista vaurioista tämän öljyn käytön vuoksi.
Eteerisiä öljyjä ei yleensä suositella käytettäväksi koirilla, koska näillä erittäin tiivistetyillä tuotteilla voi olla haitallisia vaikutuksia erityisesti pienelle eläimelle. Jotkut asiantuntijat väittävät, että teepuuöljy -shampoo on turvallinen koirille, mutta sitä tulee käyttää varoen. Monet eläinlääkärit eivät suosittele minkään teepuuöljytuotteen käyttöä pienille eläimille, mukaan lukien kissat ja koirat.
Monet asiantuntijat uskovat, että öljy voi aiheuttaa vakavia vaurioita koiran hengityselimille ja maksalle. Nielemällä teepuuöljyä neurologiset häiriöt voivat vahingoittaa koiran tasapainoa ja koordinaatiota. Jotkut koirat ovat myös kokeneet kohtauksia, kun ne ovat altistuneet teepuuöljytuotteille tietyn ajan kuluessa.
Vaikeissa myrkyllisyystapauksissa koira voi kärsiä halvaantumisesta tai koomasta. Ilmoitetuissa tapauksissa nämä oireet olivat ilmenneet laimentamattoman teepuuöljyn käytöstä. Asiantuntijat ovat yleisesti samaa mieltä siitä, että tätä öljyä ei saa koskaan käyttää laimentamattomassa muodossa, ei lemmikeille eikä ihmisille.
Kuten kaikki lääkkeet tai yrttituotteet, myös teepuuöljy, jota käytetään paikallisesti koirilla, voi aiheuttaa allergisia reaktioita. Jopa laimennetussa muodossa öljy voi aiheuttaa oireita eläimillä, joilla on herkkyysongelmia tai allergioita. Jotkut allergisen reaktion oireet teepuuöljylle koirille ovat aivastelu, nokkosihottuma, ihottuma ja hengitysvaikeudet. Koiran, joka kokee jonkin näistä oireista teepuuöljytuotteille altistumisen jälkeen, on saatava nopea eläinlääkärinhoito.
Teepuuöljyä käytetään usein tehokkaana kirppukarkotteena, ja sitä löytyy myös muista koiranhoitotuotteista. Usein käytettäessä öljystä peräisin olevat toksiinit voivat kerääntyä asteittain, eikä aiheuta havaittavia oireita varhaisessa vaiheessa. Teepuuöljyn toksisuuden varhaiset oireet ovat letargia ja ruokahaluttomuus. Kun tällaiset oireet tulevat ilmeisiksi, koira voi olla jo kärsinyt vaurioita suurille elimille.