Vaikka kookospähkinää pidettiin aikoinaan epäterveellisenä ruokana, jossa on runsaasti tyydyttyneitä rasvoja, kookospähkinän terveyshyödyt ovat tulleet ilmeisemmiksi. Kookosöljyn ja lihan tyydyttynyt rasva on erilaista kuin voin tai naudanlihan kaltaisten tuotteiden tyydyttynyt rasva, ja siitä voi olla hyötyä, mukaan lukien kilpirauhasen toiminnan parantuminen ja sydämen terveyden parantaminen. Pähkinä sisältää myös lauriinihappoa, jolla voi olla virus- ja antibakteerisia ominaisuuksia. Muita kookospähkinän terveyshyötyjä ovat kadonneiden elektrolyyttien täydentäminen ja ihmisen ihon ja hiusten kunnon parantaminen.
Kookosöljyssä ja muissa kookospähkinätuotteissa, kuten raastetussa kookospähkinässä, oleva tyydyttynyt rasva koostuu keskipitkäketjuisista triglyserideistä pitkäketjuisten triglyseridien sijasta, joista muiden tuotteiden, lihan ja kasviöljyn sisältämä rasva koostuu . Yksi kookospähkinän terveydellisistä eduista on se, että ihmiskeho voi hajottaa keskipitkäketjuisia triglyseridejä helpommin kuin pitkäketjuisia triglyseridejä. Vaikka keho varastoi pitkäketjuisia triglyseridejä, se polttaa keskiketjuisia triglyseridejä, mikä kiihdyttää aineenvaihduntaa, lisää energiaa ja joissakin tapauksissa laihduttaa.
Muita kookospähkinän terveyshyötyjä ovat sydänkohtausriskin pieneneminen joissakin tapauksissa. Kun henkilö syö kookoslihaa tai käyttää öljyä ja käyttää ruokavaliota, jossa on paljon vihanneksia ja hedelmiä ja vähäisiä eläintuotteita, hänellä voi olla pienempi sydänsairauksien riski. Kookosöljyssä oleva rasva ei lisää LDL- tai huonon kolesterolin määrää, ja se voi nostaa HDL- tai hyvän kolesterolin tasoa.
Lauriinihappo tarjoaa muita kookospähkinän terveysvaikutuksia. Kun ihminen syö kookospähkinää, keho muuttaa lauriinihapon monolauriiniksi, yhdisteeksi, joka tuhoaa bakteereja, sieniä ja viruksia. Kookos on yksi ainoista luonnollisista lauriinihapon lähteistä. Rkl (15 ml) kuivattua, silputtua kookoslihaa sisältää noin 2 grammaa lauriinihappoa, kun taas ruokalusikallinen (15 ml) kookosöljyä sisältää 7 grammaa. Suositeltu päivittäinen määrä hyödyn saavuttamiseksi on 10–20 grammaa.
Kookosvesi, pähkinän sisällä oleva neste, sisältää kehon tarvitsemia elektrolyyttejä, kuten kaliumia ja natriumia. Se on myös luonnollinen glukoosin lähde. Kookospähkinöiden vesi voi olla sopiva korvike urheilujuomille, mutta koska se sisältää sokeria, sitä tulisi käyttää kohtuudella.
Jotkut ihmiset käyttävät kookosöljyä hiuksiinsa pehmentämään ja kosteuttamaan niitä. Öljy on myös hyvä ihon kosteusvoide ja voi helpottaa kuivan ihon aiheuttamaa kutinaa. Joissakin tapauksissa kookosöljy voi helpottaa tai ehkäistä ihon ryppyjä.