On olemassa monia erilaisia aminohappotyyppejä, jotka toimivat proteiinien perusrakenneyksiköinä ja palvelevat monia muita tärkeitä biologisia toimintoja. Ne on ryhmitelty useisiin luokkiin useiden eri tekijöiden perusteella, kuten mekanismit, joiden avulla ne syntetisoidaan ja voidaanko ne hankkia ruokavalion kautta vai ei. Kaikki aminohapot sisältävät amiiniryhmän tai yhdisteen, jossa on typpeä yksinäisen elektroniparin kanssa. Niillä on myös karboksyylihapporyhmä, jotka ovat happoja, jotka sisältävät yhdisteen, joka on kiinnittynyt hiiliatomiin, happiatomiin ja hydroksidimolekyyliin. Eri tyyppejä erottaa sivuketju, joka on ainutlaatuinen jokaiselle aminohapolle.
Erilaisia aminohappoja ryhmitellään tavallisesti vakio- ja ei -standardeihin aminohappoihin. Normaalit aminohapot tuotetaan normaaleissa biologisissa prosesseissa, joiden kautta DNA: n sisältämä geneettinen tieto transkriboidaan RNA: han ja käännetään aminohapoiksi. On olemassa 20 aminohappoa, jotka tuotetaan tällaisilla tavanomaisilla biologisilla prosesseilla, kun taas kaksi muuta standardiaminohappoa tuotetaan erikoistuneemmilla synteesiprosesseilla, jolloin vakioaminohappojen kokonaismäärä on 22.
Toisaalta ei -standardeja aminohappoja ei tuoteta normaaleilla transkriptio- ja translaatiokeinoilla. Ne ovat tyypillisesti muunnettuja versioita tavanomaisista aminohapoista; niille tehdään jonkinlainen translaation jälkeinen muutos, joka tapahtuu proteiinituotannon normaalien vaiheiden jälkeen. Proteiinit, joilla on erittäin spesifisiä toimintoja tai joiden täytyy sitoutua tiettyihin molekyyleihin, sisältävät usein epästandardeja aminohappoja, koska 22 standardiaminohappoa eivät ole riittävän erikoistuneita.
Erilaisia aminohappoja ryhmitellään myös eri eläinten, yleensä ihmisten, ravitsemustarpeiden perusteella. Välttämättömiä aminohappoja, kuten fenyylialaniinia, elimistö ei voi itse syntetisoida, joten ne on kulutettava osana ruokavaliota terveyden ylläpitämiseksi. Välttämättömiä aminohappoja, kuten alaniinia, keho voi syntetisoida, joten niitä ei välttämättä tarvitse sisällyttää ruokavalioon. Termit “olennainen” ja “ei-välttämätön” eivät viittaa niiden tärkeyteen; molemmat tyypit ovat välttämättömiä. Se viittaa vain siihen, että toinen on olennainen osa ihmisen ruokavaliota, kun taas toinen ei ole.
Aminohapot voidaan jakaa luokkiin monien eri ominaisuuksien perusteella. Yksi biokemiassa yleisesti käytetty piirre on aminohapporakenne. Eri aminohapot ryhmitellään yhteen tiettyjen atomien tai molekyylien tai niiden sisältämien rakennejärjestelyjen perusteella. Kaksi erilaista rakenteellista luokkaa ovat aromaattiset aminohapot ja rikkiä sisältävät aminohapot.