Painonpudotukseen tarkoitetussa naturopatiassa on hyödyt, jotka palautuvat kehon kemialliseen ja hormonaaliseen tasapainoon, lievittävät masennusta ja parantavat yleistä terveyttä ravitsemuksella ja harjoituksilla, jotka yhdistävät mielen ja kehon. Monet lihavat ihmiset kääntyvät naturopatian puoleen laihduttaakseen ilman leikkauksen tai ruokavalion pillereiden mahdollisesti vaarallisten kemikaalien riskiä. Toinen naturopatian etu laihtumiseen on se, että lääkäri, tyypillisesti endokrinologi, luo yksilöllisen laihtumissuunnitelman kunkin potilaan erityistarpeiden huomioon ottamiseksi. Lopullinen etu, jonka laihtuminen naturopatian kautta tarjoaa, on kehon kaikkien kudosten säilyttäminen paitsi tarpeeton rasva; tämä etu erottaa naturopatian muista painonpudotusmenetelmistä, jotka usein uhraavat lihaskudoksen ja luukudoksen äärimmäisessä ponnistelussa laihduttaakseen kiloja.
Tärkein teoria painonpudotuksen naturopatian takana on, että potilaat, jotka ovat olleet riippuvaisia muista laihdutusmekanismeista, ovat muuttaneet haitallisesti kehon toimintoja aiheuttaen negatiivisia sivuvaikutuksia, jotka tekevät mahdottomaksi laihdutuksen. Näitä kielteisiä sivuvaikutuksia ovat kilpirauhasen toimintahäiriö, masentunut aineenvaihdunta, stressi ja hormonaalinen epätasapaino hormonitoimintajärjestelmässä. Tällaiset vaikutukset johtuvat tyypillisesti jatkuvasta ruokavaliosta, rajoittavista syömissuunnitelmista, jotka rajoittavat vakavasti hiilihydraatteja tai proteiineja, ja äärimmäisestä kalorien vähentämisestä, joka lähettää kehon säilyttämis- tai nälkätilaan. Vielä yksi naturopatian etu on, että se välttää kaikkia näitä tuhoisia strategioita pyrkien palauttamaan anaboliset reaktiot ja kataboliset reaktiot, jotka yhdessä luovat kehon aineenvaihdunnan. Naturopaths uskovat, että aineenvaihdunta on tärkein tekijä laihtuminen ja jos se on tasapainoinen, laihtuminen tapahtuu tehokkaasti.
Kohtaakseen naturopatian hyödyt laihtumiseen potilaat käyvät ensin läpi useita seulontoja hormonitasojen, verensokerin ja kilpirauhasen tehokkuuden mittaamiseksi. Naturopaattiset lääkärit analysoivat myös veri-, uloste- ja virtsanäytteitä. Tuloksia käytetään sitten kalibroimaan yksilöllinen painonpudotusstrategia, joka kohdistuu kaikkiin fysiologisiin epätasapainoihin.
Yksilölliset suunnitelmat ohjaavat potilaita mitä syödä, milloin syödä ja millaista liikuntaa tehdä. Mielen ja kehon harjoituksia, kuten joogaa tai pilatesta, käytetään usein luonnonhoidossa laihtumiseen. Suuri määrä hedelmiä ja vihanneksia naturopaattisessa lähestymistavassa on lisäetu siitä, että se auttaa lihavia ihmisiä puhdistumaan jalostettujen elintarvikkeiden kemikaaleista, jotka saattavat estää niiden laihtumista. Tasapainoisen ravinnon ja liikunnan lisäksi lääkärit sisällyttävät yrttejä, teetä ja tinktuureja naturopatiaan laihtumissuunnitelmiin. Akupunktiota, psykologista neuvontaa, hierontaa ja hypnoterapiaa voidaan myös käyttää potilaan hyödyksi.