Perinteinen taksonomi on biologi, joka luokittelee organismit niiden fyysisten tai soluominaisuuksien mukaan. Nämä tutkijat yrittävät myös määrittää näiden organismien välisiä evoluutiosuhteita. Kun uusi organismi löydetään, olipa kyseessä kasvi, eläin tai mikro -organismi, taksonomi antaa sille linnan nimen. Toisin sanoen hän sijoittaa sen asianmukaisiin luokkiin valtakunnan, turvapaikan, luokan, järjestyksen, perheen, suvun ja lajin taksonomisilla tasoilla. Kun ihmiset viittaavat organismin tieteelliseen nimeen, kuten koiran tunnettuun nimeen, Canis familiaris, he käyttävät kyseisen organismin suku- ja lajimerkintöjä.
Taksonominen luokittelu on suoritettu monin eri tavoin vuosien varrella. Muodollisen taksonomian alkuaikoina biotekniikka oli hyvin rajallista, ja tutkijoiden oli luokiteltava organismit vain havaittavien fyysisten ominaisuuksien perusteella. Kun evoluutioteoria kehittyi 19 -luvun puolivälissä, taksonomit alkoivat luokitella organismeja ryhmiin, joita edustavat kehityspuun oksat. Lajeja, jotka asuvat oksilla lähellä toisiaan, katsottaisiin läheisesti sukua evolutiivisessa mielessä, kun taas lajeja, jotka asuvat oksilla kaukana toisistaan, olisivat vain etäisiä sukulaisia.
Suhteita, jotka osoittavat organismien asemat evoluutiopuussa, kutsutaan fylogeneettisiksi suhteiksi. Nyt kun tutkijoilla on kyky sekvensoida deoksiribonukleiinihappoa (DNA) eliöiden soluissa, fylogeneettiset suhteet voidaan määrittää tarkemmin. Tämä analyysitekniikka on johtanut tarkempiin kehityspuihin kuin ne, jotka taksonomit ovat kehittäneet yksin anatomiaa varten. Tutkijat käyttävät myös embryologian, serologian ja immunologian tekniikoita fylogeneettisten suhteiden määrittelemiseksi ja parantamiseksi.
Taksonomiksi ryhtymiseksi on saatava neljän vuoden tutkinto biologian alalta, yleensä mikrobiologiasta, eläintieteestä tai kasvitieteestä. Valittu erityisala riippuu taksonomin tyypistä, josta opiskelija haluaa tulla, koska taksonomit ovat yleensä erikoistuneet tiettyihin valtakuntiin. Toisin sanoen kukaan taksonomi ei luokittele uusia lajeja kaikkiin organismien valtakuntiin. Opiskelijasta tulisi esimerkiksi kasvien taksonomi tai eläinten taksonomi. Jatko -opinnot luokittelumenetelmissä vaaditaan usein, jotta joku voi tulla harjoittelevaksi ja arvostetuksi taksonomiksi.
Viime vuosina termiä taksonomia on sovellettu biologisen systematiikan ulkopuolisiin ammatteihin. Voidaan kuulla sotilaallisista tai taloudellisista taksonomeista. Nämä ovat yksinkertaisesti ihmisiä, jotka luokittelevat armeijan tai talouden näkökohdat aivan kuten biologiset taksonomit luokittelevat organismeja.