Valaiden suojeluun kuuluu paitsi valaiden, myös delfiinien, pyöriäisten ja muiden valaiden suojelu. Suurin valaiden suojelutoiminnan aktivistien käsittelemä ongelma on liiallinen metsästys. On annettu useita lakeja, jotka huipentuivat kaupallisen metsästyksen tekemiseen laittomaksi. On kuitenkin yhteisöjä, jotka ovat säästyneet tästä kiellosta ymmärtäen, että ne pysyvät kiintiössä. Valaiden suojeluun kuuluu myös meriveden laadun säilyttäminen siten, että yritykset eivät saa kaataa teollisuusjätteitään mereen.
Ajatus valaiden suojelusta syntyi alun perin, koska kalastajat metsästivät valaita liian aggressiivisesti ja aiheuttivat valaiden populaation dramaattisen laskun. Vaikka hallitusten välillä oli joitakin heikkoja sopimuksia metsästystason vähentämisestä 1930 -luvulla, nämä toimenpiteet olivat yleensä tehottomia, koska monet yhteisöt vaativat edelleen suuria saaliita selviytyäkseen. Vuonna 1946 perustettiin kansainvälinen valaanpyyntikomissio (IWC), jonka tavoitteena oli säännellä valaanpyyntiä rajoittamalla tiettyjen kausien aikana pyydettävien valaiden määrää.
Silti edes IWC: n muodostaminen ei ollut tehokas valaiden säilyttämistoimenpide. Alueet, joihin IWC: n määräykset vaikuttivat eniten, noudattivat hitaasti sääntöjä. Todettiin, että useimmat valaanpyyntialueet toimittivat IWC: lle vääriä saalistietueita. Tämän seurauksena IWC päätti lainsäädännön täydellisestä uudistamisesta, joka kielsi valaiden kaupallisen metsästyksen vuonna 1982.
Poikkeuksia kaupallisen valaanpyynnin kieltoon on kuitenkin. Tietyt yhteisöt saavat pyytää valaita, koska käytännön täydellinen kieltäminen näillä alueilla voi johtaa nälkään. Grönlannin, Siperian ja Alaskan kaltaisille alueille myönnetään tietty valaiden kiintiö, jonka he saavat saalis selviytyäkseen.
Valaiden suojeluprosessi ei kuitenkaan lopu kaupallisen metsästyksen estämiseen. Valaat ja delfiinit kärsivät vakavasti meren pilaantumisesta. Eri valmistusyritykset syyllistyvät jätteen kaatamiseen mereen. Esimerkkejä mereen heitetystä jätteestä ovat kemikaalit, jätevesi, öljy ja jopa ydinmateriaalit.
Tämä pilaantuminen vaikuttaa veden laatuun, mikä puolestaan vahingoittaa meressä elävää vesielämää. Delfiinit ja valaat, jotka altistuvat vedessä oleville raskasmetalleille, voivat kuolla myrkytykseen. On havaittu, että valaita syövät ihmiset voivat olla vaarassa lyijymyrkytyksestä ja muista saastuneen veden ongelmista.