Kun ruoka sulatetaan, se kulkee mahasta ohutsuoleen ja sitten paksusuoleen. Matkan varrella eri hapot ja muut aineet ovat vuorovaikutuksessa ruoan kanssa hajottaakseen sen ja mahdollistamaan sen, että keho voi imeä sen tarjoamat ravintoaineet. Sekä haima että maksa yhdistyvät ohutsuoleen pohjukaissuolessa lisäämällä suolistoon tärkeitä aineita, kuten sappia, insuliinia ja glukagonia. Kohtaa, jossa ne yhdistävät suolistoon, joka sijaitsee pohjukaissuolen suurella papillalla puolivälissä pohjukaissuolen toisella puoliskolla, kutsutaan vaterin ampulaksi.
Tunnetaan myös nimellä hepatopankreatic ampulla, vaterin ampulla kuljettaa sapen yhteisestä sappitiehyestä sekä eritteitä haimasta haiman kanavan kautta ohutsuoleen. Useat sulkijalihakset varmistavat, että eritteet ohjataan oikeaan paikkaan ja estävät ohutsuolen sisällön virtaamisen takaisin ampullin läpi. Sappikanavassa ja haiman kanavassa on sulkijalihakset nesteen virtauksen säätämiseksi. Toinen sulkijalihas, hepatopankreatic sulkijalihaksen, ohjaa nesteen liikkumista hepatopankreatic ampulla. Tämä sulkijalihas tunnetaan myös Oddin sulkijalihaksena.
Yksi seuraus eritteistä, jotka eivät virtaa tasaisesti ruoansulatuskanavan läpi, voi olla haimatulehdus. Tämä sairaus voi ilmetä, kun vaterin ampula tukkeutuu, esimerkiksi sappikivellä. Kun vaterin ampula on tukossa, haiman tuottamat ruoansulatusmehut, jotka sisältävät insuliinia ja glukagonia, aktivoituvat haimasta pohjukaissuolen sijaan. Haiman solut ärtyvät, mikä johtaa tulehdukseen. Haimatulehdus viittaa haiman tulehdukseen ja se voidaan jäljittää myös moniin muihin syihin. Oireita voivat olla vatsakipu, pahoinvointi ja vatsakipu, joka leviää alaselkään.
Harvoin syöpä voi kehittyä maksan ja haiman ampullassa, ja sen oireita ovat keltaisuus ja kipu. Kuten useimmat syövät, varhainen havaitseminen johtaa parempaan toipumismahdollisuuteen. Yhdysvalloissa diagnosoidaan tyypillisesti alle 2,000 tapausta vuodessa, ja tämä luku on vain kaksi kymmenesosaa yhdestä prosentista kaikista diagnosoiduista ruoansulatuskanavan pahanlaatuisista kasvaimista. Tämäntyyppinen syöpä esiintyy sekä miehillä että naisilla yhtä usein ja sitä hoidetaan poistamalla syöpä sekä osa sairastuneesta pohjukaissuolesta. Vaterin ampullin syöpä metastasoituu usein imusolmukkeisiin, ja viiden vuoden eloonjäämisaste on vain noin 40 prosenttia.