Vedenalainen arkeologi tutkii vesistöissä sijaitsevia historiallisia kohteita, haaksirikkoja ja biologisten aineiden jäänteitä. Kuten maalla olevat arkeologit, nämä henkilöt tutkivat näitä rakenteita ja materiaaleja oppiakseen menneistä sivilisaatioista ja sukupuuttoon kuolleista eläimistä. Jotkut arkeologit ovat valtion virastojen tai oppilaitosten palveluksessa, kun taas toiset ovat yksityisten yritysten palveluksessa.
Jokaisen, joka haluaa tulla vedenalaiseksi arkeologiksi, on suoritettava arkeologian perustutkinto -ohjelma. Jotkut yliopistot tarjoavat myös jatko -opintokursseja merenkulun arkeologiassa, jotka valmistavat yksilöitä erityisesti haasteeseen kerätä näytteitä ja kerätä tietoja veden alla. Joissakin tapauksissa ihmiset, jotka ovat suorittaneet sekä perustutkinnon että maisterin tutkinnon, jatkavat opintojaan myös arkeologian tohtoriksi, ja ihmiset, jotka suorittavat nämä kurssit, voivat usein löytää työpaikan luennoitsijoina suurissa yliopistoissa.
Haaksirikko voi olla vedenalaisen arkeologin painopiste, joka on ensisijaisesti kiinnostunut ihmiskunnan historiasta. Tällaiset yksilöt sukeltavat merenpohjaan ja yrittävät löytää upotettujen alusten jäänteet. Joidenkin vesistöjen, kuten Mustanmeren, olosuhteet ovat erityisen suotuisat säilyttämiselle; arkeologit voivat usein löytää muinaisia veneitä, jotka ovat täysin ehjiä tällaisista paikoista. Sukelluksen aikana arkeologi voi kerätä koruja, ruokailuvälineitä ja muita esineitä kalastusverkkoon tai erikoisastiaan ja viedä nämä tavarat takaisin veneeseen ennen kuin ne kuljetetaan laboratorioon, jossa tutkimus voidaan suorittaa. Jotkut arkeologit keräävät myös ihmisen jäänteitä, kuten luurankoja ja hiusnäytteitä saadakseen lisätietoja henkilöistä, joita kuljetettiin näillä huonolla kohtalolla olevilla aluksilla.
Joillakin maailman alueilla merenpinnan nousu tarkoittaa, että muinaisten sivilisaatioiden rakentamat rakenteet ovat nyt veden alla. Arkeologit suorittavat kyselyitä näistä paikoista ja etsivät lapioilla ja muilla työkaluilla esineitä, jotka voivat olla piilossa raunioiden joukossa. Vedenalainen arkeologi voidaan varustaa vedenalaisella kameralla, jolloin voidaan ottaa valokuvia suurista rakenteista ja käyttää niitä myöhemmin opetusmateriaalina, kun valokuvaaja on palannut kuivaan maahan. Muut arkeologit etsivät näytteitä muinaisesta meren elämästä, joka voi olla luunpalasia tai fossiileja. Kuten ihmisiin liittyviä esineitä, näitä näyttelyitä tutkitaan niin, että tutkijat voivat oppia eläimistä, jotka kerran asuivat maapallolla.
Yliopistojen ja korkeakoulujen palveluksessa olevat arkeologit johtavat usein sukelluksiin kohteisiin, jotka voivat kiinnostaa muinaisia kulttuureja tutkivia opiskelijoita. Hallituksen työllistämät arkeologit keräävät materiaaleja, jotka joskus esitetään museoissa. Muut tällä alalla työskentelevät ihmiset suorittavat kyselyjä energiayhtiöiden tai konepajayritysten puolesta. Näiden henkilöiden tehtävänä on varmistaa, että vedenalaisilla alueilla ei ole historiallisia rakenteita, jotka voisivat estää yrityksiä rakentamasta näille alueille.