Kiropraktiikan ja aivohalvauksen suhde on kiistanalainen, ja tutkijat tarjoavat todisteita sekä linkin väittäjille että suhteiden kiistäjille. Rajoitetun määrän aivohalvauksia, jotka tapahtuvat kiropraktiikan manipulaation aikana tai heti sen jälkeen, on raportoitu olevan tilastollisesti liian pieniä tallennettavaksi, mutta ne voivat aiheuttaa riskin potilaille, jotka saavat kaulan säätöjä. Jotkut terveydenhuollon ammattilaisten ryhmät ovat julkaisseet lehdistötiedotteita, joissa varoitetaan potilaita saamasta kiropraktisia säätöjä kaulaansa aivohalvauksen riskin vuoksi.
Selkärangan manipulointi tai säätö on kiropraktiikkatekniikan yleisimmin käytetty muoto; kuitenkin on olemassa joitakin linkkejä aivohalvaukseen kaulan manipuloinnista. Kiropraktiikka on terveydenhuollon ammatti, joka vaatii laajaa koulutusta ja lupia tekniikoiden harjoittamiseen. Aivohalvaus on sairaus, joka johtuu aivoihin virtaavan veren muutoksesta, joka johtaa aivosolujen menetykseen ja vakavissa tapauksissa kuolemaan. Aivohalvauksen syitä ovat verisuonten puhkeaminen ja veren puuttuminen aivoihin.
Kiropraktiikan ja aivohalvauksen välisen suhteen uskotaan johtuvan niskan nopeasta liikkeestä, joka on suoritettu kiropraktiikan manipuloinnin aikana potilaan nikamiin. Kaksi valtimoa kulkee kaulan nikamien läpi, joiden verenkierto voi katketa, kun kaulaa käsitellään väkisin, mikä aiheuttaa aivojen osia veren ja hapen nälkään. Aivohalvauksen esiintymisen kiropraktiikan manipuloinnin jälkeen uskotaan tapahtuvan yhdestä kolmeen jokaista miljoonaa säätöä kohden.
Tieteellinen tutkimus ei pysty tarjoamaan selvää yhteyttä aivohalvauksen ja tapahtuman aikaan tapahtuneen sopeutumisen välillä. Kiropraktiikkajärjestöt väittävät, että aivohalvaus voi tapahtua milloin tahansa, ja kiropraktikon vierailu aivohalvauksen aikaan ei takaa korrelaatiota näiden kahden välillä. Tutkimus raportoi myös, että aivohalvaukseen liittyvät kiropraktiikan manipulaatiot tekevät usein ihmiset, jotka eivät ole koulutettuja ja päteviä tekemään säätöjä. Kiropraktiikan ja aivohalvauksen väliset yhteydet ovat riittävän pieniä, jotta esiintyminen olisi pienempi kuin kauneushoitolan aivohalvausoireyhtymä, kun asiakas saa aivohalvauksen nojautumisesta pesualtaan päälle.
Vakuutusmaksut kiropraktikoille Yhdysvalloissa vuonna 2002 osoittavat, että yhdeksän prosenttia kaikista korvausvaatimuksista tehtiin aivohalvaustapauksista kiropraktiikkapotilailla. Väitetään, että kiropraktikkojen suorittamat manipulaatiot aiheuttavat enemmän aivohalvauksia kuin raportoitu, koska sairauden oireet etenevät vähitellen useiden päivien aikana. Kiropraktikkoalan ammattilaiset ilmoittavat, että yhteys kiropraktiikan ja aivohalvauksen välillä on pieni, kun säädöt tehdään asianmukaisesti koulutetuilla ammattilaisilla.