Midatsolaamin sivuvaikutukset ovat yleensä lieviä eivätkä aiheuta merkittäviä terveysriskejä, vaikka kaikista uusista tai häiritsevistä oireista, jotka kehittyvät tämän lääkityksen aloittamisen jälkeen, on ilmoitettava lääkärille lisäarviointia varten. Jotkut tämän rauhoittavan aineen yleisimmin raportoiduista sivuvaikutuksista ovat pahoinvointi, näön hämärtyminen ja uneliaisuus. Vakavampia sivuvaikutuksia, joista on ilmoitettava heti lääkärille, ovat epäsäännöllinen syke, kouristukset ja hengitysvaikeudet. Erityisistä kysymyksistä tai huolenaiheista mahdollisista sivuvaikutuksista tulee keskustella määräävän lääkärin kanssa.
Uneliaisuus ja huimaus ovat yleisimpiä midatsolaamin sivuvaikutuksia, koska tätä lääkettä käytetään rauhoittamaan potilaita ennen tiettyjä lääketieteellisiä toimenpiteitä tai leikkauksia. Pahoinvointia ja oksentelua raportoivat myös monet, joille annetaan tätä lääkettä, ja muita lääkkeitä annetaan usein pyrittäessä vähentämään näiden oireiden vakavuutta. Runsas oksentelu voi aiheuttaa komplikaatioita, kuten kuivumista tai ruoansulatuskanavan vaurioita. Jos midatsolaamia annetaan injektiona, ihon ärsytys ja epämukavuus pistoskohdassa ovat mahdollisia.
Näön hämärtyminen, suun kuivuminen ja yskä ovat suhteellisen yleisiä sivuvaikutuksia, jotka yleensä häviävät lääkityksen lopettamisen jälkeen. Alentuneet kaliumpitoisuudet ovat mahdollisia seurauksia tämän lääkkeen käytöstä, ja väliaikainen täydennys saattaa olla tarpeen. Koordinaation puute tai lihashallinnan menetys voi ilmetä, varsinkin jos tätä lääkettä käytetään liikaa ja liiallinen sedaatio kehittyy.
Vakavia sydämeen liittyviä midatsolaamin sivuvaikutuksia on raportoitu midatsolaamia käytettäessä, joten määräävän lääkärin on ilmoitettava kaikista sydänsairauksista. Epäsäännöllinen sydämenlyönti, äkilliset verenpaineen muutokset tai rintakipu voivat viitata mahdollisesti hengenvaarallisten komplikaatioiden kehittymiseen, ja lääkärin on arvioitava ne välittömästi. Kouristukset, hallitsemattomat lihasten liikkeet tai äkillinen kyvyttömyys puhua normaalisti ovat myös mahdollisia midatsolaamin sivuvaikutuksia.
Allergiset reaktiot ovat mahdollisia käytettäessä mitä tahansa lääkettä, mukaan lukien midatsolaami, vaikka lääke on ollut hyvin siedetty aiemmin. Lievät reaktiot voivat aiheuttaa ihottumaa, kutinaa tai rakkuloita iholla. Vakavamman tyyppinen allerginen reaktio, joka tunnetaan nimellä anafylaksia, on tiedetty aiheuttavan äkillisen kuoleman ja vaatii ensiapua. Yleisiä anafylaktisia oireita ovat kielen tai kurkun turvotus, hengitysvaikeudet ja tajunnan menetys. Muut haittavaikutukset ovat mahdollisia, joten on tärkeää keskustella kaikista henkilökohtaisista huolenaiheista valvovan lääkärin tai hoitohenkilökunnan kanssa.