Kuten kaikki muutkin lääkkeet, erityisesti kaikki huumausaineet, metadonia voidaan käyttää tarkoituksellisesti tai tahattomasti väärin ja aiheuttaa vakavia terveysriskejä, kun sitä käytetään muiden lääkkeiden kanssa. Kun henkilö ottaa metadonia ja alkoholia yhdessä, hän voi kokea monenlaisia fyysisiä ja emotionaalisia ongelmia. Yleisiä fyysisiä sivuvaikutuksia ovat pienet oireet, kuten päänsärky, huimaus tai pyörtyminen, hengenahdistus, ahdistuneisuus ja pienet ruumiinsäryt sekä vakavampia oireita, kuten hengitys- ja sydänongelmat, aistiharhat ja tajuttomuus. Alkoholi voi myös nopeuttaa metadonin vieroitusprosessia, mikä voi aiheuttaa henkilölle voimakasta fyysistä kipua ja henkistä stressiä, joka voi johtaa heihin takaisin käyttämään vaarallisempia opiaatteja. Pahimmillaan metadonin ja alkoholin sekoittaminen voi johtaa kuolemaan.
Metadonin ja alkoholin ottaminen on vaarallista, koska nämä aineet vaikuttavat ihmisen kehoon. metadoni ja alkoholi luokitellaan molemmat masennuslääkkeiksi, jotka voivat estää refleksejä, hidastaa sykettä, alentaa verenpainetta ja rajoittaa hengitystä. Kun nämä kaksi ainetta otetaan yhdessä, vaikutukset vahvistuvat.
Esimerkiksi henkilö, joka aloittaa metadonihoito -ohjelman, voi aloittaa suurella päivittäisellä annoksella. Hän voi jo kokea joitakin hermoston masennuslääkkeiden yleisimpiä oireita. Jos henkilö lisää alkoholia seokseen, nämä kaksi ainetta lisäävät oireita. Hengenahdistus tai hengitysvaikeudet voimistuisivat. Henkilö, jolla on muita sairauksia, kuten astma, voi altistua tajuttomuudelle.
Henkilö, joka käyttää metadonia ja alkoholia samanaikaisesti, kokee todennäköisesti huimausta. Hengitysongelmien lisäksi henkilöllä voi olla sydänvaivoja. Kun metadoni ja alkoholi reagoivat, henkilön verenpaine ja syke voivat laskea jyrkästi. Tämä yhdistelmä aiheuttaa suuren sydänkohtauksen riskin, ja verenpaineen laskiessa aivoihin lähetetään vähemmän happea aiheuttaen huimausta.
Huimauksen lisäksi henkilö voi hallusinoida aivojen hapenpuutteen ja muiden neurologisten reaktioiden vuoksi. Myös refleksitoimet, joihin kuuluu hengitys, vaikuttavat. Kun hengitys vaikeutuu ja syke heikkenee, henkilö voi kokea rintakipuja. Henkilö tuntee olevansa yhä enemmän päihtynyt oireiden edetessä.
Metadonin ja alkoholin ottamisella on myös joitain psykologisia vaikutuksia. Molempien aineiden tiedetään heikentävän kykyä ajatella selvästi. Tuomion menettäminen on yleinen sivuvaikutus. Muita vaikutuksia ovat lyhytaikainen muistin menetys, muistinmenetys ja esto tai epätoivon tunne.