Munuaiset ovat vastuussa jätteiden suodattamisesta kehosta ja virtsan muodostumisesta. Kun bakteerit tulevat munuaisiin, yleensä virtsaputken kautta tunnetun putken kautta, joka yhdistää virtsarakon kehon ulkopuolelle, infektio voi kehittyä. Antibiootteja käytetään lähes aina näiden infektioiden hoitoon. Joitakin saatavilla olevia antibiootteja munuaistulehdukseen ovat fluorokinolonit, beetalaktaamiantibiootit, trimetopriimi ja ko-trimoksatsoli. Parhaiden antibioottien valinta riippuu infektioiden vakavuudesta ja esiintymistiheydestä sekä potilaan yleisestä terveydestä.
Fluorokinoloneja käytetään yleisesti munuaisinfektion hoitoon. Nämä lääkkeet kuuluvat luokkaan, joka tunnetaan laajakirjoisina antibiooteina. Tämä tarkoittaa, että niitä voidaan käyttää monenlaisten infektioiden, mukaan lukien munuaisinfektioiden, hoitoon. Tämäntyyppistä antibioottia käytetään pääasiassa silloin, kun munuaisongelmia on ollut jatkuvasti. Tuhkarokkoa muistuttava ihottuma voi esiintyä joillakin tämän tyyppistä antibioottia käyttävillä potilailla.
Beetalaktaamiantibiootit ovat yleisimmin käytettyjä antibiootteja munuaistulehduksessa. Tähän luokkaan kuuluvat muun muassa penisilliini ja amoksisilliini. Tämän antibioottiryhmän mahdollisia sivuvaikutuksia ovat pahoinvointi, oksentelu tai ripuli. Näiden antibioottien käytön yhteydessä on myös raportoitu vakavista allergisista reaktioista. Kaikkia kasvojen turvotuksia tai hengitys- tai nielemisvaikeuksia on pidettävä lääketieteellisissä hätätilanteissa.
Trimetopriimi on toinen vaihtoehto, kun harkitaan munuaisinfektion hoitoa. Tämän tyyppistä antibioottia käytetään lähes yksinomaan munuaisinfektioiden hoitoon. Tätä antibioottia ei pidetä turvallisena raskaana oleville naisille, erityisesti ensimmäisen kolmanneksen aikana. Muut lääketieteelliset häiriöt, kuten tietyt verisairaudet, voivat estää tämän tyyppisen antibiootin olevan sopiva valinta. Potilaan on tärkeää varmistaa, että lääkkeitä määräävällä terveydenhuollon tarjoajalla on täydellinen ja tarkka sairaushistoria ennen tämän tyyppisen antibioottihoidon aloittamista.
Co-trimoxatsole-antibiootit ovat myös suosituimpia antibiootteja munuaisten infektiolle. Tämä on itse asiassa kahden eri lääkkeen, sulfametoksatsolin ja trimetopriimin, yhdistelmä. Jotkut potilaat ovat raportoineet erilaisia toksisia vaikutuksia käyttäessään tämän tyyppistä antibioottia. Tämä on saanut monet maat kieltämään tämän tyyppisten lääkkeiden käytön. Lääketieteen ammattilaiset, jotka määräävät ko-trimoksatsoliantibiootteja, seuraavat tyypillisesti potilasta tarkasti hoidon aikana potilaan terveyden ja turvallisuuden varmistamiseksi.
Kaikilla lääkkeillä on mahdollisia negatiivisten sivuvaikutusten riskejä. Tästä syystä potilaan tulee ilmoittaa kaikista uusista oireista heti lääkärille. Monissa tapauksissa antibiootti voidaan muuttaa sellaiseksi, joka voi toimia paremmin yksittäisen potilaan kannalta.