Kiveskystien hoito riippuu yleensä kysta -tyypistä. Jotkut lääkärit neuvovat jättämään kystat yksin, jotka eivät näytä epäilyttäviltä, nähdäkseen, poistuvatko ne itsestään. Lääkärit käyttävät toisinaan neuloja vetämään nestettä ulos ongelmallisista kystistä, jotka ovat vaarattomia, mutta eivät näytä pienenevän ajan myötä. Nämä kystat voidaan myös poistaa kirurgisesti. Kiveksiin muodostuu joitain syöpä- ja syöpää edeltäviä kystat, ja ne poistetaan yleensä myös kirurgisesti. Vaikka monet kiveksen kystat osoittautuvat vaarattomiksi, niiden löytäneiden miesten tulisi aina käydä lääkärinsä luona, jotta he olisivat turvassa.
Heti kun kivekset kiveksissä havaitaan, lääkärin vierailu ja ultraääni ovat todennäköisesti tarpeen. Ultraäänen pitäisi auttaa lääkäriä määrittämään kystin luonne, mikä voi auttaa häntä päättämään, minkä tyyppistä hoitoa jatkaa. Kivekset kiveksissä ovat usein spermatoceles, joita esiintyy, kun sperma jää loukkuun pieneen nesteellä täytettyyn pussiin ihon alle. Spermatoceles ei yleensä vaadi hoitoa, ja lääkärit neuvovat usein potilaitaan käyttämään odottavaa lähestymistapaa tämän tyyppisen kystan kanssa. Jos kysta ei pienene tai katoa ajan myötä, potilaan on ehkä mentävä takaisin lääkäriin ja poistettava kysta joko tyhjennettävä tai poistettava kirurgisesti.
Vaikka spermatoceles eivät yleensä ole kivuliaita kystat, muut kiveksen kystat ovat. Jos kivekset kiveksissä aiheuttavat miehelle äärimmäistä kipua, hänen lääkärinsä todennäköisesti jatkaa eteenpäin ja poistaa sen kirurgisesti, jotta hänen potilas voi saada helpotusta. Kystin poistaminen kiveksistä on tyypillisesti avohoitoa, mikä tarkoittaa, että miehen ei yleensä tarvitse jäädä yöksi sairaalaan. Toimenpide voidaan tehdä lääkärin vastaanotolla paikallispuudutuksella. Toipumisen pitäisi olla pääosin valmis kahden viikon kuluessa, jolloin voi olla tarpeen palata lääkärin vastaanotolle seurantakäyntiä varten.
Kivekset kiveksissä, jotka ovat syöpää tai syöpää edeltäviä, on lähes aina poistettava kirurgisesti. Kirurgisen poiston lisäksi sädehoito tai kemoterapia voivat olla tarpeen sen mukaan, kuinka pitkälle syöpä on levinnyt tai onko se levinnyt muihin kehon osiin. Lääkärien on yleensä suoritettava koepalat kiveskystille sen määrittämiseksi, ovatko ne syöpää, mutta biopsioita ei yleensä tilata, elleivät ensimmäiset ultraäänitutkimukset osoita syöpämassojen läsnäoloa. Useimmat kiveksen kystat eivät ole syöpää, mutta lääkärin on tarkastettava kaikki kystat riippumatta.