Antibioottihoitoa doksisykliiniä pidetään tehokkaana hoitona kuppaan, joka on mahdollisesti kuolemaan johtava sukupuolitauti (STD). Yleisimmin käytetty hoito tähän sairauteen on penisilliini, mutta doksisykliini tulee tyypillisesti lähietäisyydeltä ja sitä käytetään, jos henkilö on allerginen tai ei pääse penisilliinille. Huolimatta siitä, että tätä antibioottia pidetään tehokkaana taistelussa kuppaa vastaan, se vaatii yleensä pitkäaikaista hoitoa. Potilasta voidaan esimerkiksi ohjeistaa ottamaan 200 mg tätä lääkettä päivittäin vähintään 20 päivän ajan. On tärkeää huomata, että kuppahoidon aloittamisen odottaminen voi tehdä doksisykliinistä tehotonta – onnistunut hoito riippuu tyypillisesti taudin tunnistamisesta ja hoidosta sen alkuvaiheessa.
Vaikka doksisykliinin käyttö kuppaan on tehokasta, se ei ole ensisijainen hoito tälle mahdollisesti tappavalle sukupuolitaudille. Lääkärit suosivat yleensä hoitoa penisilliini -antibiootilla. Lääkäri voi kuitenkin määrätä doksisykliinin, kun henkilö tarvitsee hoitoa, mutta ei voi ottaa penisilliiniä. Sitä voitaisiin käyttää esimerkiksi potilaille, jotka ovat allergisia penisilliinille tai kun penisilliiniä ei ole saatavilla alueella.
Jos henkilö käyttää doksisykliiniä kuppaan, sitä pidetään yleensä tehokkaana taudin ensimmäisen ja toisen vaiheen aikana. Jos hoito aloitetaan kuppa myöhäisessä vaiheessa, potilas on todennäköisesti kärsinyt elimiä. Hoito tässä vaiheessa voi auttaa estämään lisävaurioita elimille, mutta se ei voi korjata vahinkoa, jonka henkilö on jo kokenut. Tästä syystä lääkärit suosittelevat hakeutumaan hoitoon mahdollisimman pian.
Lääkärit määräävät yleensä noin 200 mg doksisykliiniä kuppahoitoa varten niille, jotka aloittavat hoidon taudin alkuvaiheessa, ja potilaat käyttävät sitä usein päivittäin noin 20 päivän ajan. Latentin vaiheen kuppa, joka on oireiden puute, on usein sama: 200 mg. Tyypillisesti potilaiden on kuitenkin jatkettava lääkityksen ottamista pidemmän aikaa, kun hoito alkaa piilevässä vaiheessa. Esimerkiksi lääkärit voivat sen sijaan suositella 30 päivän hoitoa. Lääkärit suorittavat yleensä verikokeita hoidon jälkeen määrittääkseen, kuinka tehokas lääkitys on ollut, ja joskus hoito on toistettava.
Doksisykliinin tehokas käyttö kuppaan tarkoittaa lääkärin määräämän koko lääkitysjakson ottamista. Jos henkilö ei tee sitä, bakteerit, jotka aiheuttavat tämän STD: n, voivat tulla resistenttejä antibiooteille. Tämän seurauksena sen hoito voi osoittautua paljon vaikeammaksi.