Ennen käyttöä on harkittava lapsille tarkoitettujen peräpuikkojen hyviä ja huonoja puolia. Hoidettavasta tilasta riippuen peräpuikkojen hoitomenetelmän käytön edut voivat vaihdella, mutta niihin voi kuulua tarvittavien annosten antamisen helppous ja pahoinvointia ja oksentelua kärsivän lapsen heittämä lääke. Miinuksiin kuuluu se, että peräpuikkoja on potilaalle usein epämukava käyttää ja ne voivat johtaa niiden jatkuvaan tarpeeseen esimerkiksi ummetuksessa.
On olemassa kaksi pääasiallista ehtoa, jotka voivat edellyttää peräpuikkojen käyttöä lapsella. Ensimmäinen ja yleisin on ummetus, joka voi vaatia glyseriinipuikkojen käyttöä suolen edistämiseksi. Tämän menetelmän käytön etuja muihin verrattuna on se, että jopa hyvin nuoret imeväiset voivat käyttää turvallisesti glyseriinilevyjä ja ne ovat usein vähemmän ankaria keholle kuin kemialliset laksatiivit. Ne eivät pääse verenkiertoon, mutta toimivat, koska glyseriini sulaa paksusuolen sisällä ja voitelee kovettuneet ulosteet, mikä helpottaa niiden kulkua.
Yksi lapsille tarkoitettujen laksatiivisten peräpuikkojen haittapuoli on, että jos niitä käytetään liian usein, lapset voivat tulla riippuvaisiksi niistä. Peräpuikon asettaminen glyseriinin sulamisen lisäksi suolen liikkeeseen stimuloi myös peräsuolen lihaksia. Tämä
sillä on myös laksatiivinen vaikutus aiheuttamalla tahatonta rasitusta. Joskus tällainen usein tapahtuva stimulaatio voi aiheuttaa riippuvuuden, mikä tarkoittaa, että sulkijalihakset voivat heikentyä ja tarvitsevat keinotekoista stimulaatiota jokaiseen suolen liikkeeseen.
Muita lapsille tarkoitettuja peräpuikkoja käytetään pahoinvointiin ja oksenteluun. Näitä käytetään, kun oksentelu on niin voimakasta, että suun kautta otettava lääke ei pysy alhaalla. Lääkkeiden annetaan päästä tehokkaasti kehoon ja hoitaa oireita, mikä on tärkeää pienillä lapsilla, koska voimakas oksentelu voi johtaa kuivumiseen.
Tämän tyyppisten peräpuikkojen käytön haittoja lapsille ovat se, että ne ovat usein epämukavia ja voivat johtaa voimakkaaseen suoliston tarpeeseen. Tämä tunne yleensä ohittaa, kun peräpuikko on sulanut, mutta voi olla erittäin epämiellyttävä tällä välin. Potilailla, jotka kärsivät myös ripulista, lisäys voi stimuloida suolen liikkeitä. Lapset voivat myös tuntea itsensä tietoisiksi, jos vanhempi tai lääkäri lisää lääkkeen.
Lapsille tarkoitettuja peräpuikkoja ei saa käyttää, ellei muita hoitomenetelmiä ole saatavilla tai niitä ei suositella jostain syystä. Vaikka ne eivät yleensä ole vaarallisia, rektaalisesti lisättyjen lääkkeiden käyttö voi olla epämukavaa sekä vanhemmalle että lapselle. Kuten kaikkien lääkkeiden kohdalla, vanhempien tulee neuvotella lääkärin tai apteekkihenkilökunnan kanssa ennen peräpuikkojen käyttöä. Kuulemista suositellaan erityisesti käytettäessä alle kahden vuoden ikäisen lapsen kanssa.