Metronidatsoli ja klindamysiini ovat molemmat antibiootteja, mutta niiden toimintatavat, sivuvaikutukset ja tavallisesti hoidettavat infektiotyypit eroavat toisistaan. Vaikka molemmat ovat antibiootteja, metronidatsoli on tehokas anaerobisten bakteerien ja eri loisten alkueläinten aiheuttamiin infektioihin. Klindamysiini on tehokas sekä aerobisiin että anaerobisiin bakteeri -infektioihin ja malariaa aiheuttavaan alkueläimeen. Metronidatsoli häiritsee tiettyjä solutoimintoja aiheuttaen bakteerien tai loisten kuoleman. Klindamysiini ei tappaa bakteereja, vaan estää niitä lisääntymästä.
Molemmat lääkkeet ovat saatavana suun kautta ja paikallisesti. Metronidatsolia on saatavana tabletteina, kapseleina, emulsiovoiteena, geelinä ja injektiona. Näiden muotojen lisäksi klindamysiiniä tulee myös oraalisuspensiona, ajankohtaisena vaahtona ja liuoksena aknen hoitoon. Klindamysiinin ja muiden lääkkeiden yhdistelmiä käytetään myös aknen hoitoon.
Klindamysiiniä määrätään vakaviin bakteeri -infektioihin. Tämä antibiootti hoitaa ihon, veren, sisäelinten ja muita infektioita. Klindamysiiniä käytetään myös hammasinfektioihin tai sydäninfektioiden ehkäisyyn tietyillä potilailla, joille tehdään hammashoitoa. Metronidatsoli torjuu anaerobisia bakteeri -infektioita keuhkoissa, suolistossa, nivelissä ja ruoansulatuselimissä. Lisäksi sitä käytetään alkueläinten, kuten amoeban ja Giardian, aiheuttamien sairauksien hoitoon.
Metronidatsolin ja klindamysiinin sivuvaikutuksilla on joitain yhtäläisyyksiä, mutta myös useita tärkeitä eroja. Kaikki antibiootit voivat aiheuttaa häiriöitä suoliston hyödyllisessä bakteerifloorassa. Tämä voi johtaa ripuliin ja suoliston kouristuksiin. Klindamysiini on kuitenkin yhdistetty vakavaan suolistosairauteen, jonka aiheuttavat lääkeresistentit bakteerit. Resistenttien bakteerien lisääntyminen hoidon aikana ja sen jälkeen voi harvinaisissa tapauksissa johtaa mahdollisesti hengenvaaralliseen tilaan.
Sekä metronidatsoli että klindamysiini aiheuttavat yleensä lievää ripulia, pahoinvointia ja oksentelua. Metronidatsolin sivuvaikutukset pahenevat alkoholin käytön seurauksena ja voivat aiheuttaa vakavan krapulan. Muita metronidatsolin yleisiä sivuvaikutuksia ovat metallinen maku suussa, päänsärky ja ruokahaluttomuus. Ihmisten ei pitäisi maata heti klindamysiinin ottamisen jälkeen, koska seurauksena voi olla pahoinvointia, närästystä tai ripulia. On suositeltavaa, että potilaat kertovat terveydenhuollon tarjoajilleen epätavallisista tai vakavista oireista käyttäessään jompaakumpaa lääkettä.
Ainakin yhdessä tutkimuksessa todettiin, että metronidatsolilla ja klindamysiinillä oli eroja bakteeriresistenssissä naisten bakteerivaginoosin hoidon aikana. Molemmat tutkimusryhmät käyttivät emättimen valmistetta joko metronidatsolista tai klindamysiinistä. Tutkijat havaitsivat, että bakteeriresistenssi klindamysiinille oli merkittävästi suurempi bakteeri -vaginosis -hoitoa saaneilla naisilla, etenkin hoidon jälkeen. Bakteeriresistenssi metronidatsolille oli hyvin vähäinen. He havaitsivat Escherichia coli -pitoisuuksien nousun klindamysiinillä hoidetussa ryhmässä, mutta hyötyneen laktobasillin lisääntymisen naisilla, jotka saivat metronidatsolia hoidon päätyttyä.