Yleisimmät amoksisilliinireaktiot johtuvat yleensä allergioista. Pienemmällä määrällä ihmisiä voi esiintyä ei-allerginen ihottuma, joka ilmenee yleensä useita päiviä amoksisilliinin ottamisen jälkeen. Allergiset reaktiot voivat vaihdella lievistä vakaviin kutina-, pahoinvointi- ja oksentelutapauksiin, ja on yleensä suositeltavaa ottaa yhteyttä lääkäriin heti, kun ne havaitaan. Jotkut potilaat ovat raportoineet myös muita reaktioita, kuten henkisiä muutoksia, ahdistusta ja unettomuutta. Tapauksissa, joissa amoksisilliinin yliannostus on nielty, yleiset reaktiot voivat alkaa uneliaisuudesta ja mahdollisesti päättyä munuaisvaurioon.
Jotkut ihmiset ovat allergisia beetalaktaamiantibiooteille, kuten amoksisilliinille, joten on suositeltavaa seurata huolellisesti mahdollisten sivuvaikutusten esiintymistä, kun käytät jotakin näistä lääkkeistä ensimmäistä kertaa. Kun allergisia reaktioita amoksisilliinille esiintyy, ne alkavat tyypillisesti kutinaa. Kutina voi olla paikallista sormenpäissä ja nivusissa, vaikka se tyypillisesti leviää nopeasti muihin paikkoihin. Kutinaan voi liittyä myös ihottuma.
Muut reaktiot amoksisilliinille ilmenevät tyypillisesti pahoinvoinnin muodossa ja voivat aiheuttaa oksentelua tai ripulia. Kuume voi myös kehittyä, mutta tätä ei ehkä huomaa, jos amoksisilliinin sairauden oli tarkoitus hoitaa jo kuume. Kaikki nämä yleiset reaktiot amoksisilliinille voivat muuttua vakaviksi hyvin nopeasti, ja sekä oksentelu että ripuli voivat johtaa kuivumiseen. Voi olla viisasta hakeutua lääkärin hoitoon heti, kun oireet alkavat.
Ei-allergista ihottumaa voi esiintyä myös harvemmin. Vaikka nämä ihottumat muistuttavat usein läheisesti allergisia reaktioita, lääkäri voi yleensä kertoa eron. Nämä ihottumat ovat yleensä kutiavia ja esiintyvät yleensä noin kolme päivää amoksisilliinin ensimmäisen ottamisen jälkeen. Ne, joilla on Epstein-Barrin viruksen aiheuttama mononukleoosi, voivat kokea tämän tyyppisen ei-allergisen reaktion amoksisilliinille todennäköisemmin kuin muut.
Haittavaikutuksen tyypistä tai vakavuudesta riippumatta yhteyttä lääkäriin on tyypillisesti paras tapa käsitellä amoksisilliinireaktioita. Jos kyseessä on allerginen reaktio, oireet voivat kehittyä hyvin nopeasti ja muuttua vakaviksi ja mahdollisesti jopa hengenvaarallisiksi. Tapauksissa, joissa tällaisia reaktioita esiintyy, beetalaktaamiantibiootteja, kuten amoksisilliinia, vältetään yleensä hoidettaessa tulevia sairauksia. Ei-allerginen amoksisilliini-ihottuma ei kuitenkaan estä tämän lääkeryhmän muita reseptejä.