Juurikanavan jälkeisen kivun käsitteleminen voi olla haastavaa; kivun hallinta voidaan kuitenkin saavuttaa ottamalla reseptivapaata kipulääkettä. Kipulääkkeitä, jotka voivat auttaa, ovat tulehduskipulääkkeet, kuten naprokseeninatriumtabletit, ibuprofeeni tai asetaminofeeni. Nämä valmisteet auttavat myös vähentämään turvotusta, joka usein liittyy juurikanavaan. Äärimmäisen kivun tapauksissa hammaslääkäri voi määrätä vahvempia kipulääkkeitä.
Jääpakkauksen levittäminen kasvojen kylkeen voi myös auttaa vähentämään kipua juurikanavan jälkeen. Jään kylmyys voi myös lievittää turvotusta, mutta jäätä ei saa laittaa suoraan paljaalle iholle paleltumavaaran takia. Vaikka jotkut saattavat hakea helpotusta lämmitystyynyn asettamisesta leukaan, sitä ei suositella. Kuumuus voi aiheuttaa kudoksen turvotusta ja joskus pahentaa kipua. Lisäksi lämmitystyynyn asettaminen vaurioituneelle alueelle saattaa jopa edistää verenvuotoa.
Asetaminofeeni voidaan ottaa myös juurikanavan jälkeen. Tätä kipua lievittävää lääkettä suosivat usein ihmiset, jotka eivät voi ottaa tulehduskipulääkkeitä mahaärsytyksen vuoksi. Lisäksi asetaminofeeni on yleensä paras kipulääke ihmisille, jotka käyttävät verenohennuslääkkeitä. Ibuprofeeni tai muut tulehduskipulääkkeet voivat tehostaa verenohennusaineiden tai antikoagulanttien vaikutusta ja aiheuttaa voimakasta tai epänormaalia verenvuotoa.
Kun juurikanavan jälkeinen kipu muuttuu vakavaksi tai sietämättömäksi, hammaslääkäri saattaa suositella reseptilääkkeitä. Tämä on yleisintä silloin, kun reseptivapaat lääkkeet eivät auta lievittämään kipua. Tietyntyyppiset juurikanavan reseptilääkkeet sisältävät kodeiinia, ja vaikka nämä lääkkeet ovat erittäin tehokkaita kipua vastaan, niillä voi olla vaarallisia sivuvaikutuksia. Reseptilääkkeiden sivuvaikutuksia voivat olla voimakas uneliaisuus, huimaus, ummetus ja sekavuus.
Kodeiinia sisältäviä reseptilääkkeitä tulee ottaa vain, jos kipua ei voida hallita muilla keinoin. Lisäksi, jos sivuvaikutuksia ilmenee, hammaslääkärille on ilmoitettava välittömästi, jotta hän voi suositella vaihtoehtoista hoitoa. Kodeiinipohjaiset lääkkeet ovat huumausaineita, ja jos niitä käytetään liikaa tai pitkiä aikoja, ne voivat aiheuttaa riippuvuutta.
Jos juurikanavan jälkeinen kipu jatkuu, potilaan on ilmoitettava hammaslääkärilleen, koska hänellä saattaa olla tulehdus. Hammastulehdus voi aiheuttaa voimakasta kipua, ja kun tämä tapahtuu, antibiootteja voidaan joutua määräämään. Antibioottihoidon aloittamisen jälkeen potilas saattaa huomata, että hänen kipunsa on vähentynyt merkittävästi. Vaikka kivun lievitystä voidaan havaita jo yhden päivän hoidon jälkeen, kaikki antibiootit on käytettävä, jotta infektio ja kipu eivät palaa.