Yleisimmin raportoidut penisilliinin sivuvaikutukset ovat myös lievimpiä. Niitä ovat tilat, jotka aiheuttavat ensisijaisesti epämukavuutta, kuten vatsakipu ja pahoinvointi. On myös useita aiempia tiloja, kuten munuaissairaus ja antibioottien haittavaikutukset yleensä, mikä voi lisätä mahdollisuuksia haittavaikutuksiin. Joillakin lääkkeillä voi olla haitallisia vuorovaikutuksia myös penisilliinin kanssa.
Useat yleiset ja lievät penisilliinin sivuvaikutukset eivät vaadi ensiapua, vaikka niistä tulisi keskustella lääkärin kanssa, jos ne pahenevat tai eivät häviä. Nämä ovat myös penisilliinin käytön yleisimmin raportoituja vaikutuksia. Vatsakipu, pahoinvointi, ihottuma ja oksentelu ovat kaikki mahdollisia vaikutuksia. Potilaat voivat myös havaita liiallista vuotoa emättimestä tai kutinaa. Muita raportoituja oireita ovat päänsärky, turvonnut, musta kieli tai sammas, joka on valkoisten laikkujen kasvua kurkun ja suun sisällä.
Vaikeammat penisilliinin sivuvaikutukset on ilmoitettava välittömästi lääkärille. Näitä voivat olla muutokset virtsaamisen tiheydessä, verinen tai vetinen ripuli ja flunssan oireet, kuten kehon kipu, vilunväristykset ja kuume. Myös allergista reaktiota, johon voi kuulua hengitysvaikeuksia, nokkosihottumaa ja kasvojen turvotusta, pidetään vakavana. Potilaiden tulee myös ilmoittaa epätavallisista ihosairauksista, mukaan lukien helppo verenvuoto tai mustelmat ja vaikea ihon kuorinta, kutina tai ihottuma. Myös levottomuus, sekavuus, kohtaukset tai sähkökatkot ovat mahdollisia.
Joillakin lääkkeillä ja lisäravinteilla voi olla vaarallinen vuorovaikutus penisilliinin kanssa ja aiheuttaa muita haittavaikutuksia. Lääkärille on kerrottava, jos potilas käyttää metotreksaattia tai probenesidiä. Koska muut lääkkeet ja kasviperäiset lisäaineet voivat myös olla ongelmallisia, potilaiden tulee kertoa kaikki käyttämänsä lääkkeen määräävälle lääkärille.
Tietyt aiemmat tai nykyiset olosuhteet voivat myös lisätä riskiä ottaa penisilliiniä. Nämä on ilmoitettava lääkärin määräävälle lääkärille, koska se voi estää potilaan ottamasta lääkettä tai edellyttää vähintään tarkempaa seurantaa sen ottamisen aikana. Astmasta, hyytymis- tai verenvuotohäiriöistä ja munuaissairaudesta on keskusteltava lääkärin kanssa. Potilaan tulee myös kertoa aiemmat antibiootin ottamisesta aiheutuneet ripulin kokemukset.
Penisilliini on antibiootti. Se toimii tappamalla infektioita aiheuttavia haitallisia bakteereja kehossa. Lääke oli ensimmäinen lääke, jolla hoidettiin onnistuneesti useita vakavia bakteerisairauksia, mukaan lukien stafylokokki tai staph, infektiot ja kuppa. Vaikka monenlaiset bakteerit ovat kehittäneet vastustuskyvyn lääkkeelle vuosien käytön aikana, penisilliiniä käytetään edelleen yleisesti ja menestyksekkäästi useiden sairauksien hoitoon.