Verkkosivuston kumppaniohjelmien avulla kauppiaat voivat maksaa tytäryhtiöille liikenteen ohjaamisesta tiettyyn verkkosivustoon. Kumppanisivuston tai -blogin korvaaminen on mahdollista eri tavoilla, joista yleisin on myyntihinta. Tämä palkitsee kumppanin prosenttiosuudella jokaisesta hänen tekemästään myynnistä. Toisaalta toimintakohtaiset kumppaniohjelmat maksavat kumppanille tietyistä toimista, kuten ilmaisen kokeilujakson tai tilin hankkimisesta. Vähiten yleinen tyyppi on napsautuskohtainen hinta, joka maksaa kumppanille vierailijakohtaisesti.
Kaikentyyppiset verkkosivustojen kumppaniohjelmat perustuvat samoihin perusperiaatteisiin korvausmenetelmästä riippumatta. Verkkosivusto, jolla on kumppaniohjelma, tarjoaa mahdollisuuden maksaa kumppanille liikenteestä, joka on lähetetty kyseiselle verkkosivustolle joko kumppanin oman verkkosivuston kautta tai muulla tavalla. Etuna on, että verkkosivustokauppias vastaanottaa liikennettä ilman, että sitä tarvitsee tuottaa suoraan, ja kumppani voi ansaita rahaa myymättä omaa tuotetta tai palvelua.
Myyntihinta (CPS) on yleisin verkkosivustojen kumppaniohjelmatyypeistä. Tällä korvausmenetelmällä kumppani saa palkkion jokaisesta kumppanin verkkokävijöiden ostamasta tuotteesta. Fyysisten tuotteiden palkkioprosentti on usein 5–20% kumppaniohjelmasta riippuen. Digitaalisten tuotteiden, kuten e -kirjojen, provisio voi olla paljon korkeampi.
Toimintakohtaiset verkkosivuston kumppaniohjelmat ovat samanlaisia kuin CPS, mutta kumppanille maksetaan, kun kävijä suorittaa toiminnon tuotteen ostamisen sijasta. Tämä voi olla tilin luominen tai sähköpostiosoitteen syöttäminen. Toimeksiantokustannusten kumppanipalkkiosta maksettava korvaus on usein kiinteä summa eikä prosenttiosuus. Monet tytäryhtiöt pitävät toimintokohtaisia verkkosivustojen kumppaniohjelmia parempina kuin myyntihintoja, koska on usein helpompaa saada kävijä rekisteröitymään ilmaiseen tiliin kuin tekemään ostoksia.
Harvinaisempi kumppaniohjelma on napsautuskohtainen hinta. Tämän tyyppisellä ohjelmalla kumppani saa palkkion jokaisesta kauppiaan verkkosivustolle lähetetystä kävijästä riippumatta siitä, kuinka moni ostaa tuotteen tai suorittaa toimenpiteen. Jokaisen napsautuksen arvo riippuu yleensä kävijöiden arvosta tietyillä markkinoilla sekä liikenteen laadusta. Liikenteen laatu vaihtelee riippuen liikenteen lähteestä ja siitä, kuinka kiinnostuneita kävijät todennäköisesti ovat verkkosivuston tuotteista.