Sertifioidun sekin etuja ovat maksun taattu ja välitön saatavuus, vähentynyt petosmahdollisuus ja shekin kirjoittajan kyvyttömyys peruuttaa maksu jälkikäteen. Useimmat pankit varmentavat shekkinsä tilinomistajilleen. Näin tehdessään pankki hyväksyy lisävastuun ja lupaa ehdoitta maksaa sekin kaikissa olosuhteissa. Jos varmennettua sekkiä ei jostain syystä makseta esitellessään, se on ensisijaisesti vastuussa pankista ja sekkilaskija vain toissijaisesti.
Pankki varmentaa shekin vetämällä välittömästi varoja shekin kattamiseksi asiakkaan tililtä ja luomalla shekkiasiakirjan, joka on merkitty varmennetuksi. Tämä on päinvastainen menettelylle, jota käytetään säännöllisissä tarkastuksissa. Tilinomistaja kirjoittaa tavallisen shekin ja odottaa, että varat sen kattamiseksi ovat tilillä, kun sekki esitetään maksettavaksi. Rahaa ei tosiasiallisesti vähennetä tililtä ennen kuin vastaanottaja on tallettanut tai lunastanut sen, vaikka hän olisi voinut pitää shekin hallussaan jonkin aikaa.
Ensisijainen etu sertifioidun sekin käytön edellyttämisessä on tieto siitä, että maksu on vähennetty tililtä sekin myöntämisen yhteydessä. Pankki takaa maksun, koska se pitää periaatteessa rahat talletuksessa. Koska rahat on varattu, vastaanottajan pankin ei tarvitse lykätä varoja odottamaan sekin tyhjentämistä. Sertifioitu sekki on lähempänä käteistä kuin tavallinen sekki takuun vuoksi, ja varat ovat käytettävissä heti.
Toinen etu sertifioidun sekin käytössä on suoja petoksia vastaan. Pankit todentavat allekirjoitukset varmennetulla sekillä. Pankki laatii sekin ja allekirjoittaa sen pankin virkailijan läsnä ollessa tarkistettuaan tilinhaltijan henkilöllisyyden. Ei ole mahdollista, että huijari olisi voinut käyttää väärin jonkun tyhjää sekkiä ja allekirjoittaa väärennetyn nimen tai väärentää allekirjoituksen.
Toinen merkittävä etu sertifioidun sekin käytössä on sekin kirjoittajan kyvyttömyys lopettaa sen maksaminen tapahtuman jälkeen. Tilinomistaja voi lopettaa maksun tavallisella sekillä milloin tahansa, vaikka se on talletettu vastaanottajan pankkitilille, vaatimalla maksukiista. Tämä voi aiheuttaa vastaanottajalle taloudellisia ongelmia ja pakottaa hänet joutumaan maksamaan oikeudenkäynnin kautta. Sertifioidut sekit toimivat hyvin kuin maksumääräykset, eikä niitä voi peruuttaa maksun jälkeen.