Omaisuuserien allokointi tarkoittaa varojen jakamista säätiön sisällä tuoton maksimoimiseksi ja riskin minimoimiseksi. Yliopistot ja muut suuret laitokset rahoittavat toimintaansa, mukaan lukien taloudellisen avun antaminen opiskelijoille, investoinnit uusiin tiloihin ja rahoittavat avainhenkilöstöä ja henkilökuntaa. Nämä varat ovat kriittisiä emoyrityksen hyvinvoinnin kannalta, ja niitä tulee hallinnoida erittäin huolellisesti. Jotkut laitokset hallinnoivat omia varojaan, kun taas toiset luovuttavat ne ammattitaitoiselle varainhoitajalle, joka voi suorittaa tarvittavat työt.
Varojen yhdistelmä säätiössä on yleensä hyvin monipuolinen. Tämä on taktiikka, joka vähentää riskejä jakamalla investoinnit useisiin eri luokkiin. Vaikka investoinnit yhdelle sektorille toimisivat huonosti, muut voivat menestyä hyvin tai pysyä vakaina ja tasoittaa tietyn tilikauden tulot. Kärsivällisyys voi olla myös osa varojen kohdentamista, jolloin johtajat ovat valmiita odottamaan hyvää tuottoa sen sijaan, että he siirtäisivät varoja välittömästi pois kannattamattomista sijoituksista.
Apurahan hallinta voi olla monimutkaista. Oppilaitokset ovat tilivelvollisia opiskelijoille ja yleisölle, ja niiden on ehkä julkaistava vuosikertomukset, joissa keskustellaan investoinneista ja tuloista. Tehdessään päätöksiä säätiövarojen jakamisesta johtoryhmän on otettava huomioon laitoksen edut, varojen hyödyntäminen viime kuukausina tai vuosina sekä ajankohtaiset taloudelliset kysymykset. Huonoilla markkinoilla instituutiot voivat luottaa voimakkaasti lahjoituksiin, kun muut rahoituslähteet kuivuvat, mikä tarkoittaa, että pääoma voi loppua, vaikka tuotot pienenevät.
Rahastossa voidaan edustaa useita erilaisia omaisuusluokkia, mukaan lukien ulkomaiset ja kotimaiset sijoitukset osakkeisiin, joukkovelkakirjoihin ja muihin mahdollisuuksiin. Osa varojen allokoinnista sisältää tarkan tasapainon riskin ja tuoton välillä. Suurin tuotto liittyy suurimpaan riskiin, joka voi sulkea heidät pois yhtälöstä, koska johtaja ei halua vaarantaa omaisuutta. Vakaat tuotot ovat kuitenkin liian alhaisia vastaamaan rahaston tarpeita, joten sijoitusyhdistelmät on laskettava hyvien mutta turvallisten tuottojen saamiseksi.
Perustamisvarojen allokointia koskeva tutkimus osoittaa, että erittäin suuret lahjoitukset voivat toimia erittäin hyvin myös huonoissa taloudellisissa olosuhteissa. Suuren päämiehen aloittaminen voi helpottaa hajauttamista ja ottaa riskejä paremman tuoton saamiseksi. Konservatiiviset varojen kohdentamisstrategiat ovat yleisiä pienissä lahjoituksissa, joissa on huolta pääoman riskistä. Tämä voi kuitenkin kostautua, koska vaurauden rakentaminen voi olla vaikeaa, jos johtaja ei ota riskejä.