RNA:n hajoaminen on joidenkin yksittäisten RNA-katkelmien ja -säikeiden tuhoamista solussa. Tällä on tärkeä rooli soluprosessien säätelyssä. Koska tahansa organismin solut voivat sisältää vaihtelevia määriä RNA:ta, ja kudosnäyte voi olla alttiina hajoamiselle sekä varastoinnissa että kehossa. Kun tällaisia näytteitä käytetään tutkimukseen ja profilointiin, huononemisesta voi tulla ongelma.
Solut käyttävät RNA:ta signaalin eri prosessien alkamisesta ja päättymisestä. Solut tuottavat paljon enemmän RNA:ta kuin ne sisältävät, mikä oli ensimmäinen merkki tutkijoille siitä, että RNA:n hajoamisen täytyy tapahtua kehon sisällä, koska geneettisen materiaalin piti mennä jonnekin. Prosessia on sittemmin tutkittu useissa organismeissa, erityisesti bakteereissa, koska ne sopivat hyvin tieteelliseen tutkimukseen.
RNA:n hajoamisessa entsyymit lukittuvat juosteeseen ja katkaisevat sen. Tämä tekee viestistä hyödyttömän, koska emäsparit ovat hajaantuneet eivätkä muodosta enää täydellistä tietoketjua. RNA:n hajoamisesta vastaavat entsyymit voivat myös ohjata solun kierrättämään komponentit, jotta niitä voidaan käyttää uudelleen lisäämään RNA:ta tai muita yhdisteitä. Solun elinkaaren eri kohdissa se saattaa tarvita enemmän tai vähemmän RNA-signaaleja säädelläkseen erilaisia prosesseja. RNA:n hajoaminen sallii solujen luoda tarvitsemansa ja hävittää sen, kun he eivät tee tätä itsesäätelyn kautta.
Joillakin RNA-juosteilla on hyvin lyhyt elinikä, kun taas toiset voivat elää pidempään, koska ne ovat osa monimutkaisia ja jatkuvia prosesseja. Tutkijat voivat tarkastella erilaisia RNA-komplekseja saadakseen lisätietoja siitä, kuinka ne toimivat kehossa ja milloin ne alkavat hajota. Prosessi alkaa yleensä yhdestä säikeen päästä, aivan kuten huivin purkaminen. Entsyymit, jotka vastaavat RNA:n pilkkomisesta, voivat lukittua tiettyihin emäksiin tai pareihin ja aloittaa työnsä leikkaamalla juosteen lyhyemmiksi segmenteiksi.
Kuten DNA, RNA kuljettaa valtavan määrän tietoa ja toimii signaalin välittäjänä kehossa. Kaikki solun DNA ja RNA eivät ole aktiivisia samanaikaisesti, koska tämä aiheuttaisi hämmennystä ja tapahtumien sekamelskaa solun sisällä; esimerkiksi maksasolu yrittäisi myös toimia ihosoluna, lihassoluna ja niin edelleen, koska kaikki solujen erilaistumiseen osallistuvat geenit olisivat aktiivisia. Jokaisella solulla on suunnitelma, jonka avulla se määrittää, millainen solu se on ja minkä tyyppisiä toimintoja se suorittaa, aina RNA:n hajoamiseen saakka, jotta se pääsee eroon RNA:sta, jota se ei enää tarvitse.