Tieteellisesti tunnistettuja sienilajeja on noin 75,000 XNUMX, ja tiedemiehet uskovat, että siellä voi olla jopa miljoona sienilajia, joita ei ole vielä tunnistettu. Koska eri lajit voivat näyttää pinnalta samalta, niiden luokittelu tarkasti on vaikeaa ja vaatii yleensä molekyylityökalujen, kuten DNA -sekvensoinnin, käyttöä. Koska DNA -sekvensointi on edelleen suhteellisen kallista, jopa sienille, joiden genomit ovat paljon lyhyempiä kuin nisäkkäille, kestää todennäköisesti vuosikymmeniä, ennen kuin suurin osa luokitellaan varmasti.
Yleisiä tyyppejä ovat homeet-jotka kasvavat hyphae-nimisissä säikeissä, sienet-sienipesäkkeiden hedelmäkappaleet ja hiivat-kaikkien yksisoluisten sienien nimi. Nämä ovat kuitenkin laajoja termejä, ja muotteja, hiivoja ja sieniä löytyy useista taksonomisista luokista. Sienien luokittelu phyla -tasolla on monimutkaista ja sitä muutetaan jatkuvasti. Sienet luokiteltiin ensin kasveiksi, mutta myöhemmin tehdyissä tutkimuksissa havaittiin, että niillä on enemmän yhteistä eläinten kanssa. Kuten kasvit ja eläimet, ne ovat eukaryootteja.
Fylogeneettisesti sieniä on seitsemän. Ensimmäinen on Chytridiomycota eli kytridit, alkeellisin muoto, jossa on noin 1,000 tunnistettua lajia. Nämä tuottavat itiöitä flagellalla (zoospores) ja menevät sammakkoeläinten, maissin, sinimailanen, perunan ja muiden haavoittuvien organismien perässä. Nämä edustavat parhaiten tyyppejä, jotka asuivat koko paleozoisen aikakauden aikana, pääasiassa vesieliöillä.
Blastocladiomycota on toinen phlya, joka luotiin vain erillisenä luokana vuonna 2007. Kuten kytridit, ne käyttävät eläintarhoja lisääntymään ja loisia kaikissa suurissa eukaryoottiryhmissä. Kolmas phyla, Neocallimastigomycota, ovat anaerobisia sieniä, jotka pääasiassa vievät märehtijöiden vatsaa. Heidän nimensä sisältää kreikkalaisen jälkiliitteen, joka viittaa ruoskoihin, -mastix, lukuisten lippujensa vuoksi. Toinen ja kolmas fyla luokiteltiin alun perin väärin kytrideiksi.
Neljäs phyla on tutumpi Zygomycota, joka on nimetty niiden tuottamista kestävistä pallomaisista itiöistä. Jos näet sienen, jossa on pieniä pisteitä hyphaen (filamenttien) kärjissä, se on Zygomycota. Tähän sukuun kuuluu yli 600 lajia, ja se sisältää mustan leivän hometta, joka on yksi ihmisten yleisimmin havaitsemista. Toinen on Pilobolus, joka pystyy poistamaan itiöitä useita metrejä ilman läpi.
Viides laji on Glomeromycota, joka tunnetaan nimellä Arbuscular mycorrhizae (AM). Pohjimmiltaan tämä termi tarkoittaa “puun sieniä”. Niitä löytyy suuria määriä yli 80%: n verisuonikasvien perheistä. Tämä suhde on symbioottinen ja ikivanha, ja se ulottuu ainakin 460 miljoonan vuoden taakse, kasvien elämän alkuun maalla.
Kuudes phyla on Ascomycota, joka tunnetaan sac -sieninä. Nämä muodostavat erillisiä pallomaisia pusseja itiönsä pitämiseksi ja sisältävät eniten lajeja kaikista fyyleistä. Esimerkkejä ovat Penicillium, morels, tryffelit, leipomohiiva, jäkälät, hometta ja monet muut. Monet näistä lajeista ovat kasvipatogeenisiä.
Seitsemäs phyla ovat Basidiomycota tai klubisienet. Tämä ryhmä sisältää yleisimmät sienet. Se erottuu itiöitä tuottavasta rakenteesta, jota kutsutaan basidiumiksi, joka tunnetaan yleisemmin korkkina. Yhdessä Ascomycotan kanssa ne tunnetaan korkeampina sieninä.