Se, miten sukupuolitautien (STD) tarkistus toimii, riippuu testin suorittavasta lääkäristä ja potilaan yksilöllisistä tarpeista. Usein lääkärit ottavat huomioon potilaan kohtaamat riskitekijät päättäessään mitkä testit suoritetaan sukupuolitautitarkastuksessa, ellei potilas pyydä laajaa sukupuolitautitestausta. Kun lääkäri ja hänen potilaansa ovat sopineet suoritettavista testeistä, sukupuolitaudin tarkastukseen voi sisältyä veren ottaminen, virtsakoe tai miehen peniksen tai naisen kohdunkaulan pyyhkäisy. Fyysisiä tutkimuksia käytetään usein myös osana sukupuolitautitestausta.
Monet naiset olettavat, että sukupuolitautitarkastukset tehdään rutiini osana heidän vuotuisia gynekologisia tarkastuksia. Esimerkiksi nainen, jolla on vuosittain papa-testi, voi olettaa, että hänen lääkärinsä suorittaa myös vuosittain sukupuolitautitarkastuksia. Tosiasia on, että pap-testit voivat paljastaa merkkejä joistakin sukupuolitaudeista, mutta suurin osa niistä voi jäädä huomaamatta säännöllisistä papa-testeistä huolimatta. Lisäksi lääkärit eivät välttämättä testaa sukupuolitauteja, elleivät heidän potilaansa kuulu korkean riskin ryhmiin, kuten ne, joilla on useita seksikumppaneita. Miehet voivat olettaa, että heidän lääkärinsä tarkistavat sukupuolitaudit verikokeilla, mutta tämä ei ole rutiinitapahtuma.
Henkilön, joka haluaa perusteellisen sukupuolitautitarkastuksen, on yleensä pyydettävä sellainen lääkäriltään. Siinä tapauksessa hän voi jakaa yksityiskohtia seksielämästään auttaakseen lääkäriään määrittämään, mitkä testimuodot ovat sopivia. Lääkäri voi esimerkiksi suositella erilaisia testejä miehelle, joka on pitkäaikaisessa yksiavioisessa suhteessa, verrattuna miehelle, jolla on uusi seksikumppani tai jolla on seksiä useiden kumppanien kanssa. Testauksen suositustiheys voi myös riippua henkilön seksielämän ainutlaatuisista yksityiskohdista.
Kun henkilö on päättänyt haluamansa sukupuolitautitarkastuksen tyypistä, hänen on ehkä toimitettava erilaisia laboratorionäytteitä lääkärilleen testattavaksi. Lääkärit voivat käyttää virtsatestejä tarkistaakseen esimerkiksi tippurin tai klamydian esiintymisen. Vaihtoehtoisesti lääkärit voivat lähettää vanupuikkoja peniksen sisäpuolelta tai kohdunkaulasta laboratorioon tarkistaakseen nämä sukupuolitaudit. Verikokeita käytetään yleensä kupan, ihmisen immuunikatoviruksen (HIV) ja hepatiitin tarkistamiseen. Koska verikoe voi antaa väärän negatiivisen tuloksen näiden sairauksien infektion varhaisessa vaiheessa, uusintatestaus saattaa olla tarpeen.
Joitakin sukupuolitautityyppejä ei paljasteta veri- tai virtsakokeissa. Sukupuolielinten herpestarkistukset voivat sisältää kudosnäytteiden tai rakkuloiden eruption viljelmien analysoinnin ja fyysisen tutkimuksen potilaalle, jolla on epäilyttävä kyhmy tai haava. Ihmisen papilloomaviruksen (HPV) seulonta sisältää yleensä pap-testin naisten kohdunkaulansyövän toteamiseksi. Miehillä ei tällä hetkellä ole sukupuolitautitestiä HPV:lle.