Atsatiopriinin antaminen haavaiselle paksusuolitulehdukselle voi olla hyödyllinen ja tehokas hoito tietyissä tapauksissa. Atsatiopriini on tehokas haavaisen paksusuolitulehduksen hoidossa, koska lääkitys vaikuttaa tukahduttamalla tämän taudin aiheuttavan yliaktiivisen immuunijärjestelmän. Tärkein tapaus, jossa atsatiopriinin antaminen haavaista paksusuolitulehdusta vastaan on tehokasta, on antaa lääkäreille mahdollisuus pienentää lääkkeitä, joita kutsutaan kortikosteroideiksi, joita käytetään yleisesti tämän taudin hoitoon. Vaikka kortikosteroidit voivat estää oireiden ilmaantumisen, niiden pitkäaikaisella käytöllä suurina annoksina voi olla haitallisia sivuvaikutuksia.
Atsatiopriinin käyttö haavaiseen paksusuolitulehdukseen on osoitettu tehokkaaksi useille eri potilaille, jotka kärsivät tästä taudista. Se on tehokas, koska se muuttaa kehon immuunijärjestelmää. Erityisesti se estää deoksiribonukleiinihapon (DNA) muodostumisprosessin kehossa ja selektiivisesti tiettyjen valkosolujen toimintaa, joilla on rooli elimistön immuunijärjestelmässä. Koska haavainen paksusuolitulehdus on autoimmuunisairaus, joka johtuu osittain yliaktiivisesta immuunijärjestelmästä, joka hyökkää ihmiskehon alkuperäisiä osia vastaan, kehon immuunivasteen tukahduttaminen johtaa taudin kliiniseen taantumiseen.
Kaikkia haavaista paksusuolitulehdusta sairastavia potilaita ei tule hoitaa atsatiopriinilla. Tällä lääkkeellä on eniten hyötyä, kun sitä annetaan taudin remission ylläpitämiseksi. Haavaista paksusuolitulehdusta sairastavilla potilailla esiintyy yleensä sairauden aktiivisuutta, ja oireet, kuten verinen ripuli, vatsakipu ja kuume, pahenevat akuutisti näiden sairauden puhkeamisten aikana. Itse leimahdusta hoidetaan usein lääkkeillä, joita kutsutaan kortikosteroideiksi taudin aktiivisuuden rauhoittamiseksi ja remission mahdollistamiseksi. Kortikosteroidiannoksia pienennetään siedetysti, kun oireet alkavat kadota.
Jos potilaita ei voida vieroittaa kokonaan kortikosteroideista akuutin leimahduksen jälkeen, yksi vaihtoehto on käyttää atsatiopriiniä haavaiseen paksusuolitulehdukseen. Tämän lääkityksen lisääminen sallii usein lääkäreiden pienentää kortikosteroidiannoksia, mikä on hyödyllistä, koska kortikosteroidien pitkäaikaisella käytöllä voi olla merkittäviä sivuvaikutuksia. Joissakin tapauksissa atsatiopriinin lisääminen mahdollistaa potilaiden kokonaan poistamisen kortikosteroidihoidosta. Jotkut asiantuntijat pitävät kuitenkin atsatiopriinin käyttöä yksinään kiistanalaisena, ja he suosittelevat sekä kortikosteroidien että atsatiopriinin käytön jatkamista taudin leviämisen estämiseksi.
Yksi varoitus atsatiopriinin käytöstä haavaiseen paksusuolitulehdukseen on, että ennen tämän lääkityksen aloittamista potilaille, jotka kärsivät tästä tulehduksellisesta suolistosairaudesta, on tehtävä useita erilaisia verikokeita. Jopa tiopuriinimetyylitransferaasin (TPMT) aktiivisuus tai TPMT: tä koodaava geneettinen sekvenssi on arvioitava ennen hoidon aloittamista. Potilaita, joilla on alhainen TMPT -aktiivisuus, ei tule hoitaa atsatiopriinillä, koska heillä saattaa olla enemmän toksisia vaikutuksia tämän lääkkeen antamisesta.