Sitraatin käyttö munuaiskiviin on laajalti käytetty strategia kalsiumkivien muodostumisen estämiseksi, ja se on erittäin tehokas tapa vähentää näitä kiviä useimmilla yksilöillä. Kaliumsitraatti on tärkeä munuaiskivien estäjä, ja tämän tärkeän kemikaalin alhaiset pitoisuudet aiheuttavat suuren riskin munuaiskivien muodostumiselle. Sen varmistaminen, että virtsa ei ole liian hapan ja sisältää tarpeeksi sitraattia, voi auttaa ehkäisemään munuaiskivien muodostumista enemmän kuin todellisessa tilassa. On kuitenkin jonkin verran näyttöä siitä, että munuaiskivien käsittely magnesiumsitraatilla auttaa vähentämään kivien kokoa.
Kun virtsasta tulee liian hapanta ja kalkkeutunutta, ja kun sen kemikaalien, kuten sitraatin ja magnesiumin, määrä vähenee, munuainen altistuu suurelle vaaralle kalkkikivien kehittymiselle. Hapan elintarvikkeiden ja juomien on osoitettu lisäävän virtsan happamuutta jossain määrin, mikä auttaa tulevien munuaiskivien muodostumisessa. Esimerkiksi korkea sokerin saanti lisää veren happamuutta ja voi altistaa kehon munuaiskivien muodostumiselle, ellei se ole tasapainossa kehon terveelliseen toimintaan tarvittavien oikeiden ravintoaineiden kanssa. Yksi näistä ravintoaineista on magnesium, mutta tutkimukset osoittavat, että munuaiskivien sitraatti on luultavasti tärkein ainesosa, jota keho tarvitsee munuaiskivien ehkäisyyn.
Sitraatin täydentäminen on erittäin onnistunut estämään tulevien munuaiskivien muodostumista, mutta on vain vähän todisteita, jotka edistävät sitä nykyisten munuaiskivien hoidossa. Sitraatin onnistumisprosentti munuaiskivien ehkäisyyn on erittäin korkea, ja monet lääkärit ehdottavat usein tätä täydennystä tulevaisuuden ehkäisystrategiaksi niille, jotka ovat jo kärsineet munuaiskivistä. Munuaiskivien sitraattia pidetään parhaana ehkäisystrategiana naturopaattisten ja luonnollisten lääkäreiden toimesta. On kuitenkin epäselvää, aiheuttaako korkeampi sitraattipitoisuus lisää kehon ongelmia, joten suositeltu annos on erittäin suositeltavaa.
Tutkijat ovat havainneet, että appelsiineissa oleva sitraatti on luonnollinen tapa estää munuaiskivien muodostuminen. Itse asiassa appelsiinit näyttävät olevan paras sitraatin lähde munuaiskivien ehkäisyyn verrattuna muihin sitrushedelmiin. Yleensä ei ole suositeltavaa juoda appelsiinimehua sitraattihyötyjen saamiseksi, koska mehu sisältää enemmän sokeria kuin koko hedelmä, mikä voi lisätä virtsan happamuutta. Kehon pitäminen neutraalissa tilassa valitsemalla kokonaisia magnesiumia sisältäviä elintarvikkeita suositellaan myös ravinteiden ja kivennäisaineiden tasapainon säilyttämiseksi munuaiskivien ehkäisyohjelmaa varten.