Parhaiden jyrsijöiden karkotteiden valinta riippuu siitä, mitkä eläimet aiheuttavat ongelman, ja sijainnista. Kemialliset ja ultraäänikarkottimet ja ansat voivat auttaa jo asunnossa oleville jyrsijöille. Ennaltaehkäisevä huolto pitää jyrsijät ulkona. Esteet ja hyvät säilytyskäytännöt voivat torjua jyrsijöitä puutarhoissa ja ulkorakennuksissa. Laajojen tartuntojen yhteydessä tulee kääntyä ammattimaisen tuholaistorjuntapalvelun puoleen.
Hiiret ja rotat voidaan poistaa ansoilla ja syöteillä, mutta myrkyt eivät välttämättä ole hyvä valinta kotitalouksiin, joissa on lapsia ja lemmikkejä. Jotkut ihmiset eivät halua tappaa eläimiä, vaan käyttävät eläviä ansoja, jotka mahdollistavat kuljetuksen ja vapauttamisen. Luonnolliset jyrsijöiden karkotteet ovat turvallisia ja käyttävät tuoksuja, joista hiiret eivät pidä, mutta jotka ihmiset pitävät miellyttävinä, kuten piparminttuöljy, balsami tai sitronella. Nämä pelotteet voivat olla kotitekoisia tai ostettuja kaupoista ja verkosta.
Ultraääni jyrsijöiden karkottimet toimivat luomalla äänen, joka on ihmisen kuuloalueen ulkopuolella, mutta jyrsijöille kuuluva. Näillä laitteilla tehdyt tutkimukset ovat osoittaneet, että eläimet jättävät alueen, mutta palaavat pian takaisin, kun ne ovat tottuneet ääneen. Ultraäänikarkotteita on parasta käyttää yhdessä muiden tuholaistorjuntamenetelmien kanssa tai keinona ajaa ne pois väliaikaisesti, jotta niiden sisäänkäynnit voidaan tukkia. Marsujen ja lemmikkirottien omistajien tulee poistaa ne, kun laitteet ovat käytössä.
Naftaleenia ja rikkiä sisältäviä rakeisia jyrsijöiden karkotteita voidaan käyttää ulkona auttamaan karkottamaan jyrsijöitä vajaista tai navetoista. Jos rakennusta käytetään rehun tai viljan varastointiin tuotantoeläimille ja lemmikkieläimille, ruoka tulee pitää irti lattiasta, jotta jyrsijät eivät pääse siihen käsiksi. Ukkokasvaneet pensaat ja ruohoalueet keräävät jyrsijöitä, samoin kuin pihan kasat sotkua. Kun nämä alueet on puhdistettu, ulkopuoliset halkeamat ja reiät, joihin tuholaiset pääsevät, voidaan tiivistää, ja rakeista tuotetta tulee levittää vahingoittuneelle alueelle.
Puutarhassa esteet, kuten aidat ja pelottimet, toimivat jyrsijöiden pelotteina ja estävät ne ruokakasveilta. Aidat tulee sijoittaa vähintään kuusi tuumaa (15.24 cm) maan alle, jotta jyrsijät eivät voi kaivaa sen alle. Väärennetyt petoeläimet, kuten muovipöllöt ja liikelaitteet, voivat auttaa pelottamaan jotkin tuholaiset pois. Voimakkaasti tuoksuvien kasvien, kuten sipulin ja kehäkukan, sijoittaminen puutarhan ympärille voi myös karkottaa jyrsijöitä.
Jos jyrsijöiden karkottimilla ei ole vaikutusta tai tartunta on äärimmäistä, voidaan joutua kutsumaan tuholaistorjuntayritys. Jyrsijät ja niiden jätetuotteet kantavat sairauksia, ovat valtava uhka ihmisten ja lemmikkieläinten terveydelle ja hyvinvoinnille ja voivat aiheuttaa suurta vahinkoa kodille ja omaisuudelle. Ammattimaiset hävittäjät voivat poistaa jyrsijät ja auttaa kodin omistajia pitämään ne poissa pysyvästi.