Hedelmäkärpästartunnan torjuntaan kuuluu tyypillisesti hedelmäkärpästen ruokalähteiden poistaminen, pintojen puhdistaminen puhtaina ja säännöllisesti joko kotitekoisten tai kaupasta ostettujen hedelmäkärpäsloukkujen käyttö. Saatat myös pystyä käyttämään lentoteippiä monien hedelmäkärpästen vangitsemiseen. Vaikka voit onnistuneesti päästä eroon hedelmäkärpäsi -tartunnasta, sinun on pidettävä mielessä, että ne todennäköisesti palaavat, jos jatkat käytäntöjä, jotka houkuttelevat heidät kotiisi, kuten jätteiden jättäminen tai ylikypsät hedelmät ja vihannekset työtasosi. On tärkeintä ryhtyä toimiin hedelmäkärpästen estämiseksi loppukesän ja alkusyksyn aikana, jolloin kärpäset ovat yleensä pahimpia.
Hedelmäkärpäset eivät yleensä voi selviytyä, jos niillä ei ole mitään ravintoa. Jos huomaat suuren määrän hedelmäkärpäsiä lentämässä kotisi minkä tahansa alueen ympärillä, yritä selvittää, mikä houkuttelee niitä. Hedelmäkärpäset ovat yleensä kiinnostuneita mätänevistä hedelmistä ja vihanneksista sekä juomista, joiden annetaan istua ja käydä, kuten oluista ja virvoitusjuomista. Jos näyttää siltä, että kärpäset tulevat altaan viemäristä, yritä käyttää viemärinpuhdistinta poistaaksesi kaikki mätä ruoka, joka saattaisi houkutella heitä. Voit myös parantaa mahdollisuuksiasi hallita hedelmäkärpästartuntaa, jos kuorit roska- ja kierrätysastioiden sisäpuolen sekä roskakorien ympäristön.
Pesualtaiden ja työtasojen puhdistaminen ja peseminen perusteellisesti muutaman kerran päivässä voi myös vähentää hedelmäkärpäskantaa. Jos asiat pidetään puhtaina eikä ruokajätettä ole kärpäsiä puoleensa, ne eivät voi selviytyä pitkään. Jos jätät usein tuoreita hedelmiä ja vihanneksia pöydillesi, harkitse niiden säilyttämistä ilmatiiviissä astiassa. Tämän pitäisi estää hedelmäkärpästen houkutteleminen tuotteisiin kypsymisen aikana.
Hedelmäkärpästartunnan torjumiseksi on saatavana ansoja. Nämä ansat on tehty houkuttelemaan hedelmäkärpäsiä sisälle, ja kun hedelmäkärpäset eivät pääse pakoon. Voit tehdä tällaisia ansoja kotona täyttämällä purkin puoliksi etikkaa ja peittämällä sen yläosan muovikelmulla, joka on kiinnitetty kuminauhalla. Jos teet pieniä reikiä muovikelmun yläosaan, hedelmäkärpäset tulevat sisään, koska etikan haju vetää puoleensa, mutta ne eivät todennäköisesti pääse takaisin ulos. Näiden ansojen lisäksi voit käyttää myös teippi -ansoja useiden ympärillä leijuvien hedelmäkärpästen ja kaikkien kotikärpästen saamiseen, joiden kanssa sinulla saattaa olla ongelmia.